Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) молекулярно-цитогенетический метод анализа вариаций числа копий ДНК по сравнению с набором проб или маркеров. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) – технология молекулярно-генетического исследования.
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА)
- Общая характеристика метода
- Похожие и рекомендуемые вопросы
- Хромосомный микроматричний анализ
- Подробное описание исследования
- Хромосомный микроматричний анализ - Доктор онлайн
- Хромосомный микроматричный анализ Стандартный
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА)
- Хромосомный микроматричный анализ при выкидыше или замершей беременности
- Методы исследования хромосом
- Генетический анализ крови
- Хромосомный микроматричный анализ при неразвивающейся (замершей) беременности
Башкирские генетики разработали новый метод пренатальной диагностики
Общее Прогнозы Акции 360 Дивиденды Технический анализ Цены и риски Фундаментальный анализ Новости О компании. • Хромосомный микроматричный анализ – молекулярно-цитогенетический метод для выявления вариаций числа копий ДНК по сравнению с контрольным образцом. В Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА), позволяющий проводить.
Зачем сдают хромосомный анализ
- Генетические анализы, проведение которых финансирует фонд для благополучателей
- Строка навигации
- Опубликованы рекомендации РОМГ по ХМА
- неврологИ – Telegram
Башкирские генетики разработали новый метод пренатальной диагностики
Это позволит родителям заранее пройти лечение и родить здорового малыша. Подробности — в карточках Впервые в России в Республиканском медико-генетическом центре для пренатальной диагностики всех беременных из Республики Башкортостан используют технологию - полногеномный хромосомный микроматричный анализ. Технология позволяет исключить любые хромосомные нарушения у плода.
Присутствие в организме клеток с разными кариотипами. Это явление называется мозаицизмом. Хромосомные аберрации — нарушение структуры хромосом, внутрихромосомные и межхромосомные перестройки.
Сюда относятся делеции утрата участка хромосомы , дупликации удвоение участка хромосомы , инверсии поворот участка хромосомы на 180 градусов , транслокации перенос участка одной хромосомы в другую. Однако с помощью исследования кариотипа можно выявить не все генетические нарушения. Оно не способно обнаружить такие изменения, как: микроделеции и микродупликации, когда утрачивается или дублируется очень маленький участок хромосомы; болезни обмена, вызванные нарушением последовательности «букв» генетического кода в отдельных генах; митохондриальные заболевания, связанные с нарушениями в генетическом материале митохондрий; низкопроцентный мозаицизм, когда клеток с неправильным кариотипом очень мало; мутации в отдельных генах, которые не приводят к изменению внешнего вида хромосом; эпигенетические расстройства, при которых структура хромосом и генов не меняется, но изменяется их функция. Для получения дополнительной информации, не видимой в световой микроскоп, используют хромосомный микроматричный анализ ХМА. С его помощью можно изучить все клинически значимые участки генома и выявить изменения в количестве и структуре хромосом, а именно микрополомки микроделеции и микродупликации.
Во время хромосомного микроматричного анализа применяют технологию полногеномной амплификации и гибридизации фрагментов опытной ДНК с олигонуклеотидами, нанесенными на микроматрицу. Если объяснять простыми словами, то сначала ДНК, которую необходимо изучить, копируют, чтобы увеличить ее количество, а затем смешивают ее со специальными ДНК-микрочипами, которые помогают выявлять различные нарушения. Эта методика позволяет в одном исследовании выявлять делеции и дупликации участков ДНК по всему геному. Разрешающая способность стандартного ХМА от 100 000 пар нуклеотидов — «букв» генетического кода в отдельных регионах от 10 000 п. С помощью ХМА можно выявлять: изменения числа хромосом; дупликации и делеции, в том числе микродупликации и микроделеции; отсутствие гетерозиготности — утрату одной из двух копий гена.
Это явление имеет важное значение в онкологии, при болезнях импринтинга когда активность гена зависит от того, от какого из родителей он получен , аутосомно-рецессивных заболеваниях связанных с рецессивными генами — о них мы поговорим ниже , близкородственных браках; однородительские дисомии, когда в геноме ребенка присутствуют две хромосомы от одного родителя. Однако, как и предыдущий метод, хромосомный микроматричный анализ имеет некоторые ограничения. Он не позволяет выявлять или ограничен в выявлении таких аномалий, как: сбалансированные хромосомные аномалии, когда в хромосомах происходят изменения, которые не приводят к добавлению или утрате генетического материала. Мутации в генах и заболевания, к которым они способны приводить Мутации — это изменения, которые происходят в ДНК как случайным образом, так и под действием разных факторов, например химических веществ, ионизирующих излучений. Они могут затрагивать как отдельные «буквы» генетического кода, так и большие участки генома.
Мутации происходят постоянно, и это основной двигатель эволюции. Чаще всего они бывают нейтральными, то есть ни на что не влияют, не приносят ни вреда, ни пользы. В редких случаях встречаются полезные мутации — они дают организму некоторые преимущества. Также встречаются вредные мутации — из-за них нарушается работа важных белков, наоборот, происходят достаточно часто. Все внешние признаки и особенности работы организма, которые человек получает от родителей, передаются с помощью генов.
Это важнейшее свойство всех живых организмов называется наследственностью. В зависимости от того, как проявляются гены в тех или иных признаках, их делят на две большие группы.
Методика позволяет проанализировать одномоментно более 250 тяжелых генетических синдромов, которые невозможно выявить стандартным методом кариотипирования. Анализ может быть проведен даже в том случае, если беременность замерла давно и живых клеток в материале не осталось. Показания: Невынашивание беременности наблюдалось более, чем один раз; Невынашивание беременности произошло впервые, но у семейной пары есть желание выяснить возможную генетические причину; Во время прошлых беременностей у плода были выявлены множественные пороки развития; В семье есть ребенок с хромосомной патологией.
У детей же, получивших «дефектный» хромосомный набор, развиваются хромосомные болезни, которые проявляются пороками развития, умственной отсталостью, аутизмом, задержкой психоречевого и психомоторного развития. Тяжёлые хромосомные дефекты приводят к самопроизвольному прерыванию беременности или внутриутробной гибели плода. Исследование хромосомных отклонений методом ХМА Хромосомный микроматричный анализ ХМА — метод исследования кариотипа человека, который может выявить хромосомные нарушения, связанные с изменением структуры или числа хромосом. Наиболее распространённые хромосомные нарушения: дупликация — появление дополнительных копий генетического материала; транслокация — перенос участка одной хромосомы на другую; инверсия — изменение последовательности генетического материала. Кроме того, методом ХМА можно обнаружить и другие хромосомные аномалии, например, анеуплоидии, триплоидии, полиплоидии, микродупликации, микроделеции, несбалансированные транслокации, потерю участков гетерозиготности, однородительские дисомии. Такие аномалии часто становятся причиной наследственных заболеваний, которые можно подтвердить или исключить с помощью ХМА: синдрома Патау трисомия 13 , синдрома Эдвардса трисомия 18 , синдрома Дауна трисомия 21 , синдрома Ди Джорджи микроделеция 22-й хромосомы и многих других.
ХМА при неразвивающейся беременности
Сегодня ему на смену пришел хромосомный микроматричный анализ, который в 800 раз чувствительнее кариотипа и выявляет намного больше патологических изменений в геноме. Хромосомный микроматричный анализ - наиболее экономичный способ выявить хромосомную патологию и определить тактику дальнейшего обследования пациента. Различные цитогенетические методы Начало применения метода: 1956 год Диагностика анеуплоидий: 23 пары Чувствительность определения делеций и дупликаций хромосомных локусов: При протяженности фрагмента от 10 000 000 п. Выявление потери гетерозиготности LOH : Нет Выявление сбалансированных хромосомных транслокации: Да Количество синдромов, которые могут быть выявлены: Около 50 Fish-метод Начало применения метода: 1980 год Диагностика анеуплоидий: Заданное количество хромосом, как правило не более 12 пар Чувствительность определения делеций и дупликаций хромосомных локусов: Требуется предварительный клинический диагноз Выявление потери гетерозиготности LOH : Нет Выявление сбалансированных хромосомных транслокации: Да требуется предположительный предполагаемый характер транслокации Количество синдромов, которые могут быть выявлены: Все известные, но при наличии предварительного диагноза Молекулярное кариотипирование Начало применения метода: 2012 год Диагностика анеуплоидий: 23 пары Чувствительность определения делеций и дупликаций хромосомных локусов: От 50 000 п. Микроделеции размером от 10 КБ и микродупликации от 20 КБ во всех участках генома в области клинически релевантных генов Точное определение координат дисбаланса и его положение относительно кодирующих экзонов и других функционально активных участков гена. Определение происхождения структурного дисбаланса. ХМА выявляет: Определение участков потери гетерозиготности размером от 100 КБ Расчет доли LOH относительно всего генома и вероятности близкородственного брака родителей или происхождение их из закрытой популяции Дифференцировка LOH происходящих от обоих родителей и однородительских дисомий ОРД Определение происхождения гомозиготного участка при однородительской дисомии. Аннотирование обнаруженной перестройки в отношении генов связанных с болезнями импринтинга.
В 1990 году большая группа ученых из разных стран начала проект под названием «Геном человека». Он завершился в 2003 году и помог установить, что человеческий геном содержит 20—25 тысяч генов.
Каждый ген представлен двумя копиями, которые кодируют один и тот же белок, но могут немного различаться. ДНК находится в клетке внутри ядра. Она особым образом организована в виде хромосом — эти нитеподобные структуры можно рассмотреть в микроскоп с достаточно большим увеличением. Внутри хромосомы ДНК намотана на белки — гистоны. Когда гены неактивны, они расположены очень компактно, а во время считывания генетического материала молекула ДНК расплетается. В клетках человека есть структуры, которые называются митохондриями. Они выполняют роль «электростанций» и отвечают за дыхание. Это единственные клеточные органеллы, у которых есть собственная ДНК. И в ней тоже могут возникать нарушения.
Весь набор хромосом в клетке называется кариотипом. В норме у человека он представлен 23 парами хромосом, всего их 46. Выделяют два вида хромосом: 22 пары аутосом одинаковы у мужчин и женщин. В каждой паре хромосомы имеют одинаковую длину и содержат одинаковые наборы генов. Одна пара половых хромосом. У женщин это две X-хромосомы. Одна из них неактивна и плотно свернута — ее называют тельцем Барра. У мужчин одна половая хромосома представлена X-хромосомой, а вторая — Y-хромосомой, она меньше по размерам. Методы исследования хромосом Для исследования кариотипа применяют специальный метод — световую микроскопию дифференциально окрашенных метафазных хромосом культивированных лимфоцитов периферической крови.
Этот анализ применяется для диагностики различных хромосомных заболеваний. Он позволяет выявлять такие нарушения, как: Грубые изменения в кариотипе — изменение количества хромосом. Присутствие в организме клеток с разными кариотипами. Это явление называется мозаицизмом. Хромосомные аберрации — нарушение структуры хромосом, внутрихромосомные и межхромосомные перестройки.
ХМА - что это? Хромосомный микроматричный анализ ХМА — это вид генетической диагностики хромосомных аномалий, при котором определяются структурные изменения количества генетического материала, ДНК, в хромосомах, например, делеции и дупликации участка хромосомы. Зачем нужен ХМА анализ? Хромосомный микроматричный анализ ХМА применяется для постнатальной диагностики хромосомных аномалий, которые могут быть причиной множественных врожденных пороков и малых аномалий развития в сочетании с задержкой психомоторного развития, умственной отсталостью у ребенка, и носят название микроделеционных и микродупликационных синдромов.
Что такое микроделеционный синдром? Микроделеционные синдромы — это хромосомные заболевания, которые вызваны отсутствием маленьких участков хромосом, не видимых в микроскоп при стандартном кариотипировании. Такое отсутствие называется микроделецией.
А те ситуации, при которых эти анализы показаны, будут рассмотрены далее, в показаниях. Кариотипирование Исследованию кариотипа посвящена отдельная статья — Анализ крови на кариотип, поэтому здесь будет дана только самая краткая информация. Кариотип не способен показать отдельные гены и выявить тонкие нарушения наследственной информации. С помощью исследования кариотипа можно увидеть отдельные хромосомы, в которых собрана плотноупакованная ДНК. Как известно, у человека, так же, как и у любого другого живого вида многоклеточных организмов на нашей планете, существует уникальный набор хромосом, который называется кариотипом.
Так, в организме человека находится 46 хромосом: 44 аутосомы, которую несут общую информацию для мужчин и для женщин и 2 половые хромосомы, в которых закодированы половые различия, а также некоторые гены, сцепленные с полом гемофилия. Для того чтобы наилучшим образом увидеть хромосомы человека, необходимо подождать, пока лейкоциты в анализе крови начнут делиться, и выстраиваться в определённом порядке. В это время их фиксируют, окрашивают, фотографируют под микроскопом и идентифицируют их по хромосомным картам, опознавая по номерам. Нормальный кариотип — 46 XX или 46 ХУ у женщин и мужчин. С помощью этого метода может обнаружить крупные хромосомные расстройства: например, третью хромосому 21 пары, которая говорит о болезни Дауна, наличие многочисленных ненужных половых хромосом, и другие аномалии, связанные с отрывом частей хромосомы, удвоением, перемещением на другое место отдельного локуса и так далее. Читайте также: Что такое иммунограмма для ребенка? Кариотипирование — самый простой анализ крови для определения генетических заболеваний хромосомного характера, его стоимость составляет около 5000 рублей. По сути, врач — цитогенетик изучает наследственный материал, идентифицируя «мозаику» хромосом, и здесь все — таки задействован субъективный фактор.
Но есть и полностью объективные, «машинные» методы, например, ХМА и секвенирование. Хромосомный микроматричный анализ ХМА Можно сказать, что хромосомный микроматричный анализ является синтезом между секвенированием генов и кариотипированием. Он позволяет очень точно определить любую хромосомную патологию, и вначале исследуется все важные участки генома, и определяются грубые его нарушения. К таким нарушениям относятся повторы большого количества последовательностей, то есть дупликации или удвоения генов, отсутствие необходимых участков или делеции , перевернутая последовательность нуклеотидов, или «гены задом наперёд» — так называемые инверсии и другие расстройства. В результате хромосомного микроматричного анализа можно изучить все известные хромосомные болезни, в том числе с тонкими и незначительными нарушениями. Грубое кариотипирование с этим не справится.
Хромосомный микроматричный анализ
Но каким бы опытным ни был специалист, есть разрешающая способность человеческого глаза. Так, может быть поврежден крохотный участок в каком-то плече хромосомы, и с помощью ХМА мы его «поймаем», а простой цитогенетикой — нет. Повреждение насколько мало, что человеческий глаз его просто не заметит. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп. Существуют врожденные пороки развития, которые требуют серии операций, причем провести их необходимо в первые часы жизни ребенка.
Расширенный ХМА выполняется на микроматрице высокой плотности HD , на которой находится примерно 2,7 млн. Каждый из маркеров определяет наличие или отсутствие крайне маленькой последовательности генома размером в 25 нуклеотидов.
Разрешающая способность данного анализа от 50 тыc.
Сам метод инвазивный. Для исследования подойдет любой материал, содержащий ДНК, — ворсина плаценты или жидкость внутри плодных оболочек. Учеными анализируются отдельные фрагменты генома с использованием специально подготовленной микроматрицы.
В результате полученного метода одновременно исследуются более тысячи генов, в результате чего появилась возможность исключить более 250 тяжелых генетических заболеваний. Но каким бы опытным ни был специалист, есть разрешающая способность человеческого глаза.
Генетический материал распределён по хромосомам в строго определённом порядке, последовательность сохраняется одинаковой для всех людей. Полный хромосомный набор называют кариотипом.
В норме кариотип человека содержит 46 хромосом, которые объединены в 23 пары. Нормальный мужской кариотип — 46,XY; нормальный женский — 46,XX. В норме в каждой клетке содержится полный хромосомный набор, исключение составляют половые клетки сперматозоиды и яйцеклетки , которые содержат лишь половину набора, то есть 23 хромосомы. Во время оплодотворения при слиянии мужской и женской половых клеток формируется новый хромосомный набор, который и передаётся будущему ребёнку.
Хромосомный микроматричный анализ пренатальный в Санкт-Петербурге
| Ноябрь 2023 — Министерство науки и высшего образования Российской Федерации | Докладывает: руководитель проекта ГЕНОМЕД, врач-генетик, д.м.н., профессор Коростелев Сергей Анатольевич Теперь стандартный хромосомный микроматричный анализ (ХМА) с. |
| Скрининг показал риск синдрома Дауна у плода | РОО ОМСМ | Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп. |
| Хромосомный микроматричный анализ Стандартный | Хромосомный микроматричный анализ в диагностике причин выкидыша: анализ на 250 тяжелых генетических синдромов. |
| Генетические анализы, проведение которых финансирует фонд для благополучателей | * Обычно при хромосомном анализе можно визуально определить лишь делеции более 7-10 МБ. |
ХМА пренатальный
Анализ метилирования ДНК и анализ последовательности гена UBE3A позволяют обосновать диагноз приблизительно у 90 % пациентов. Общее Прогнозы Акции 360 Дивиденды Технический анализ Цены и риски Фундаментальный анализ Новости О компании. Докладывает: руководитель проекта ГЕНОМЕД, врач-генетик, д.м.н., профессор Коростелев Сергей АнатольевичТеперь стандартный хромосомный микроматричный анализ.
ХМА при неразвивающейся беременности
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА): генетический анализ, изучающий количество, структуру и целостность на уровне хромосом. Хромосомный микроматричный анализ. Моногенные наследственные заболевания. В Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА), позволяющий проводить. Хромосомный микроматричный анализ представляет собой сложную молекулярную технологию, при которой проводится полногеномная амплификация с последующим анализом. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА): генетический анализ, изучающий количество, структуру и целостность на уровне хромосом. В Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА), позволяющий проводить.
Цитогенетическая лаборатория
| В Башкирии генетики разработали новый метод пренатальной диагностики | "Стандартный" хромосомный микроматричный анализ проводится на микроматрице высокой плотности, которая содержит 1,16 млн. |
| Полногеномный хромосомный микроматричный анализ для пренатальной диагностики беременных | Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) позволяет диагностировать хромосомные перестройки размером от нескольких тысяч пар оснований до 5 Мb. |