по Менеджменту антикоагулянтной терапии, утвержденное Министерством Здравоохранения РМ, рекомендует для оценки рисков венозных тромбоэмболий использовать тесты на Д-Димеры со специфичностью не менее 75.
Преимущества ПЦР-диагностики в современной медицине:
- Анализ ПЦР на гепатит С: качественный, количественный, показания и подготовка | MedAboutMe
- Полезные советы
- Что такое ПЦР-тест, и для чего его сдают
- «Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест
Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
| Маркеры гепатита С и расшифровка результатов количественного анализа HCV RNA | Если ПЦР, экспресс-тест и IgM-антитела отрицательные, это скорее всего значит, что в последние 2-3 недели коронавируса у вас не было. |
| 7 вопросов про ПЦР-тест | ПЦР, или полимеразная цепная реакция, представляет собой метод обнаружения инфекций. |
| Маркеры гепатита С и расшифровка результатов количественного анализа HCV RNA | Тест на антиген коронавируса проводится по методике ПЦР, когда у пациента при помощи ватной палочки берется из глотки проба слюны. |
| Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний | Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — это лабораторно–диагностическое исследование, позволяющее определить возбудителя той или иной инфекции. |
| Анализы на ВПЧ. Что это такое и как его берут | Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – наиболее информативный, точный и современный метод диагностики инфекционных заболеваний, позволяющий обнаружить возбудителя в организме пациента, даже если количество вредоносных клеток исчисляется единицами. |
О рекомендациях, как подготовиться к сдаче ПЦР-теста на COVID-19
Чтобы это сделать, мы разрабатываем ПЦР-тест, который будет «смотреть» конкретно этот вариант из всего генома, есть он у человека или нет. В зависимости от причины проведения ПЦР-теста положительный результат может указывать на наличие исследуемого возбудителя. ПЦР анализ на инфекции Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – высокоточный метод молекулярно-генетической диагностики, который позволяет выявить у человека различные инфекционные и наследственные заболевания, как в острой и хронической стадии. Подробное описание: что такое ПЦР-тест на ковид, что показывает и как узнать результат. Как проводится забор биоматериала, как подготовиться. ПЦР или полимеразная цепная реакция является золотым стандартом в диагностике многих инфекций.
Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК
| ПЦР-тест: что это, расшифровка анализа, как его делают | ПЦР или полимеразная цепная реакция является золотым стандартом в диагностике многих инфекций. |
| Сколько стоит сдать ПЦР-анализ | Такая возможность существует при ПЦР-тесте, когда биоматериал получают с помощью соскоба эпителиальных клеток из ротоглотки. |
Расшифровка анализа пцр
В случае не обнаружения Коронавирусной инфекции по итогам ПЦР-диагностики, по запросу, мы выдаем бланк международного образца. Можете использовать его, если планируете перелёт в ближайшее время. Так какой же анализ сдать именно Вам? Разбираемся вместе. Если Вы проводите анализ на COVID-19 для какой-либо организации, то следует уточнить - Какой конкретно необходим, для самой организации. Если же Вы решили узнать для себя, то и выбирать только Вам, например: - Если Вы сдадите мазок — То узнаете, болеете ли на данный момент или нет.
То есть если в пробе с самого начала было много вредоносных молекул ДНК, то с каждым циклом полимеразной цепной реакции их будет становиться вдвое больше, а к концу процесса накопятся миллионы. Современные приборы амплификаторы следят за тем, как меняется количество копий, и по итогам исследования вычисляют примерную концентрацию возбудителя в организме пациента. Для чего это нужно? В случае с бактериями, простейшими или грибками подобные сведения имеют спорную диагностическую ценность, поскольку численность колоний постоянно меняется под воздействием самых разных факторов, да и уничтожить такие микроорганизмы сравнительно просто. Другое дело — вирус. Это неклеточная форма жизни, которую невозможно истребить подобно тому, как антибиотики справляются с бактериями. В борьбе с вирусами человек может твёрдо рассчитывать только на свой иммунитет, а возможности противовирусных средств сильно ограничены.
Именно когда дело касается вирусов, становится особенно актуальной методика ПЦР в режиме реального времени. Вирусная нагрузка или виремия — это степень тяжести поражения организма вирусом. Показатель рассчитывается путём определения числа вирионов в биологическом материале, измеряется в МЕ или в количестве копий на 1 мл крови и служит для контроля над ходом терапии и предупреждения распространения вируса. Но и в случае с другими вирусами определение нагрузки может оказаться полезным — например, когда речь идёт о цитомегаловирусе, герпесе или папилломовирусе. Анализ поможет понять, грозит ли человеку очередное обострение болезни, и насколько высока вероятность передачи инфекции. ВИЧ-инфицированным людям назначается антиретровирусная терапия. Её цель — максимально снизить вирусную нагрузку, а в идеале — сделать её неопределяемой.
Но даже в этом случае существует риск заразить своего полового партнёра или партнёршу, поэтому не следует пренебрегать использованием презервативов. При выборе типа биоматериала для диагностики врачи ориентируются на специфику инфекции, на её излюбленную локализацию. Ведь от того, попадет ли вредоносная ДНК в пробу, зависит то, будет ли получен достоверный результат анализа.
У таких пациентов даже при отсутствии инфекции результат исследования на антитела к ВГС будет положительным Тест на наличие РНК ВГС может быть выполнен в лаборатории или с помощью простого аппарата в клинике. Новые инновационные пробы, например на коровый антиген ВГС, находятся в стадии экспериментального тестирования и позволят в будущем проводить одноэтапную диагностику активной инфекции гепатита С. В случае диагностирования хронической инфекции ВГС пациента необходимо обследовать для определения степени поражения печени фиброз и цирроз печени. Это можно сделать с помощью биопсии печени или различных неинвазивных тестов. Решение относительно методов лечения и ведения пациента принимается на основе данных о степени поражения печени. Ранняя диагностика позволяет предотвратить развитие осложнений, связанных с инфекцией, и дальнейшую передачу вируса.
ВОЗ рекомендует проводить тестирование лиц в группах повышенного риска инфицирования. ВОЗ рекомендует, чтобы все взрослые имели доступ к тестированию на ВГС и имели возможность его проведения в сочетании с получением услуг по профилактике, оказанию помощи и лечению. Во всем мире хронические заболевания печени являются одной из основных причин заболеваемости и смертности среди людей, живущих с ВИЧ. Как выполняется анализ Для выявления антител к гепатиту С используется венозная кровь: Анализ удобен тем, что не требует специальной подготовки. Его сдают в утреннее время натощак. Кровь доставляется в лабораторию в чистой пробирке, после чего обрабатывается иммуноферментным методом. После образования пар «антиген — антитело» обнаруживаются те или иные иммуноглобулины. Такой анализ является первым этапом диагностики гепатита С. Ее проводят при нарушении функций печени, появлении определенных симптомов, изменении состава крови, планировании и ведении беременности, подготовке к хирургическим вмешательствам.
Антитела к вирусному гепатиту С чаще всего обнаруживаются случайно. Человека этот диагноз всегда шокирует. Однако не стоит впадать в панику, в некоторых случаях анализ оказывается ложноположительным. При выявлении антител к гепатиту необходимо и начать дальнейшее обследование. Возможные показания для проведения HCV анализа Для прохождения исследования на предмет наличия гепатита С, не нужны разрешения или направления от лечащего врача, на сегодняшний день существует масса лабораторий и медицинских центров, где любой желающий может пройти HCV анализ крови. Тем не менее, существует перечень состояний, которые являются показанием к проведению данного исследования, к ним относят: Желание стать донором. Наличие в анамнезе жизни заменного переливания крови или ее компонентов. Исключение гепатита С при наличии его вторичных признаков. Выяснение эффективности лечения гепатита С.
Сдавать HCV анализ крови необходимо не ранее чем через 5-6 недель после первичного предполагаемого заражения, в противном случае даже при наличии инфекции в организме, иммуноглобулины могут выработаться не в достаточном количестве и дать ложноотрицательный результат. Необходимо сдавать после двенадцатичасового перерыва в еде — прием пищи влияет на реологические характеристики плазмы. Забор проводить утром — это связано с тем, что большинство нормативных показателей рассчитывались в утренние часы, так что для снижения вероятности ложноположительного результата, необходимо следовать этому правилу. Необходимо исключить за сутки прием гормональных, антивирусных и цитостатических препаратов. Так же следует воздержаться от приема алкоголя вечером перед посещением лаборатории. Виды антител к гепатиту С Существует два основных класса антител к гепатиту С: Антитела класса IgM вырабатываются в среднем спустя 4-6 недель после инфицирования и, как правило, свидетельствуют об остром или недавно начавшемся процессе. Антитела класса IgG образуются после первых и указывают на хроническое и затяжное течение заболевания. В рутинной клинической практике чаще всего определяют суммарные антитела к гепатиту С Anti-HCV total. Они вырабатываются на структурные компоненты вируса спустя примерно месяц после его попадания в организм и сохраняются либо пожизненно, либо до тех пор, пока инфекционный агент не будет удален.
В некоторых лабораториях определяют антитела не к вирусу вообще, а к отдельным его белкам: Anti-HCV core IgG — антитела, образующиеся в ответ на структурные протеины вируса. Они появляются спустя 11-12 недель после заражения. Anti-NS3 отражают острый характер процесса. Anti-NS4 указывают на длительность заболевания и, возможно, имеют определенную связь со степенью поражения печени. В практической деятельности наличие антител к белкам NS3, NS4 и NS5 определяют редко, поскольку это значительно повышает общую стоимость диагностики. Более того, в подавляющем большинстве случаев выявление суммарных антител к гепатиту С и уровня вирусной нагрузки бывает достаточно для постановки положительного результата, определения стадии заболевания и планирования лечения. Кроме того, зарегистрировано более 80 субтипов генома. К каждому из них образуются антитела. Показания для сдачи анализа Антитела в крови могут обнаруживаться через несколько месяцев после инфицирования.
Поэтому человек должен пройти не менее трех тестов в следующих случаях: После незащищенного полового контакта с незнакомым партнером. Доказательств того, что гепатит С может передаваться половым путем, не найдено, однако заболевание часто обнаруживается у пациентов, ведущих беспорядочную интимную жизнь. Гепатит С диагностируют у инъекционных наркоманов. Появление антител в крови возможно после стоматологической операции, нанесения татуировок или после посещения косметолога, однако подобные случаи редки. Перед сдачей крови доноры проходят тест на анти-HCV в обязательном порядке. Анализы делаются и перед хирургическими вмешательствами. Дополнительные диагностические процедуры показаны и при повышении уровня печеночных ферментов.
Такие клетки иммунная система должна уничтожать. От поколения к поколению насчитывается всего несколько сотен мутаций на более чем шесть миллиардов букв. При этом большинство мутаций нейтральны и ни на что не влияют, так как только 1 процент из трех миллиардов букв ДНК находится в генах или регуляторных участках. Поэтому при передаче генетической информации от поколения к поколению ДНК достаточно консервативна. Человеческая природа меняется в основном комбинацией ДНК, от мамы и папы мы получаем ее разные копии, в результате у каждого ребенка разные участки этих двух родительских копий по-своему случайным образом скомбинированы и в конечном счете определяют его индивидуальность. Но это же не говорит о том, что человек — это банан. В чем здесь подвох? Можно сравнивать последовательность генов или всю последовательность ДНК. Различия между более близкими организмами, чем, к примеру, человек и банан, могут быть обусловлены не белок-кодирующей генетической последовательностью, а разницей в регуляторных механизмах. Гены могут быть одинаковыми, но включаться и выключаться по-разному. Большая часть «мусорной ДНК» может быть одинаковой. Сам язык и набор ДНК у всех живых организмов один и тот же. Исключение разве только составляют некоторые бактерии и вирусы. А что касается изменений других организмов — растений и животных — то это очень перспективная технология. Все внесенные изменения можно проверить, прежде чем использовать полученный организм. Эти изменения не представляют никакой опасности, потому что методы, которые ранее применялись для создания различных сортов в сельском хозяйстве или животноводстве гораздо сильнее меняли ДНК и гораздо в более непредсказуемых вариантах. В желудке человека все переварится одинаково — и томат с геном рыбы, и обычная рыба в томатном соусе.
В Минздраве объяснили, от чего зависит результат ПЦР-теста
Но все-таки статистически ДНК от внутренних причин повреждается больше. Достоверных хороших исследований на тему связи стресса и мутации ДНК нет. Если, гипотетически, представить механизм связи стресса и рака, то его следует искать на более высоком уровне, например, в изменениях иммунного ответа на клетки, в которых накопленные повреждения уже нельзя исправить. Такие клетки иммунная система должна уничтожать. От поколения к поколению насчитывается всего несколько сотен мутаций на более чем шесть миллиардов букв. При этом большинство мутаций нейтральны и ни на что не влияют, так как только 1 процент из трех миллиардов букв ДНК находится в генах или регуляторных участках. Поэтому при передаче генетической информации от поколения к поколению ДНК достаточно консервативна. Человеческая природа меняется в основном комбинацией ДНК, от мамы и папы мы получаем ее разные копии, в результате у каждого ребенка разные участки этих двух родительских копий по-своему случайным образом скомбинированы и в конечном счете определяют его индивидуальность. Но это же не говорит о том, что человек — это банан. В чем здесь подвох? Можно сравнивать последовательность генов или всю последовательность ДНК.
Различия между более близкими организмами, чем, к примеру, человек и банан, могут быть обусловлены не белок-кодирующей генетической последовательностью, а разницей в регуляторных механизмах. Гены могут быть одинаковыми, но включаться и выключаться по-разному. Большая часть «мусорной ДНК» может быть одинаковой. Сам язык и набор ДНК у всех живых организмов один и тот же. Исключение разве только составляют некоторые бактерии и вирусы. А что касается изменений других организмов — растений и животных — то это очень перспективная технология.
Зная нуклеотидную последовательность генома, в лаборатории можно получить участок этого генома и дальше экспериментировать уже с ним. В частности, проверить чувствительность и специфичность теста, используя вместо клинических образцов растворы ДНК. В январе у ученых большинства стран вообще и не было другого выхода, настоящие пациенты имелись только в Китае. К такому методу могут быть претензии. Например, если чувствительность теста проверяется по растворам кДНК, не учитываются потери при обратной транскрипции. Тут разные другие тонкости. Но в целом ученые сработали очень оперативно. ПЦР полимеразная цепная реакция — это метод тестирования, который способен находить генетический материал вируса непосредственно в крови пациента, слюне или любой другой жидкости, изобретенный в 1983 году американским биохимиком Кэрри Муллисом. Он основан на многократном копировании амплификации определенных участков вирусной ДНК в лабораторных условиях. По факту, чтобы «засечь» вирус в организме, с помощью специального фермента, собирающего из нуклеотидов по образцу вирусной ДНК ее копию, ученые дублируют фрагменты генетического материала вируса, пока их число не станет настолько большим, что будет возможно зафиксировать его присутствие с помощью флуоресцентных меток. Как это работает? Затем добавляют так называемые праймеры — начальные звенья цепочки, которые необходимы для старта синтеза новой копии, и так называемую полимеразу — тот самый фермент, который и будет заниматься репликацией ДНК. РНК-праймер изображен белым прямоугольником в начале каждой из двух цепей Как правило, для лабораторной ПЦР используются ДНК-полимеразы из термофильных бактерий, поскольку в течение реакции смесь многократно охлаждают и нагревают. На последующей стадии элонгации полимераза начинает синтез на каждой из двух цепочек разделенной ДНК недостающей пары. Происходит это по принципу комплементарности: фермент присоединяет напротив каждого нуклеотида, из которых состоят ДНК, противоположный. По завершении реакции цикл неоднократно повторяется см. Общая схема полимераной цепной реакции.
Мы будем очень благодарны, если Вы порекомендуете нас своим друзьям в социальных сетях. Медпортал 03online. Здесь Вы получаете ответы от реальных практикующих специалистов в своей области.
Кроме того, это позволяет одновременно, в одном и том же материале, проводить поиск нескольких возбудителей без какого-либо ущерба для качества ответа. Метод обладает высочайшей чувствительностью — мы уже говорили о том, что возможно найти всего один фрагмент генетического материала возбудителя. Несомненное преимущество метода — оперативность. Постановка реакции занимает несколько часов, таким образом, вся диагностика, от момента сдачи материала на анализ до получения результата, отнимет всего один день. При помощи ПЦР определяют возбудителя , а не реакцию на его внедрение со стороны организма. Таким образом, появилась возможность точно диагностировать заболевание еще в инкубационном периоде, когда нет никаких клинических или лабораторных признаков болезни. Но они напрямую связаны с его достоинствами и с так называемым «человеческим фактором». ПЦР — очень высокотехнологичный метод, требующий соблюдения строжайших правил оснащения лаборатории. Это связано с тем, что в воздухе постоянно присутствует невероятный коктейль из фрагментов ДНК всевозможных живых организмов, и в процессе подготовки к проведению реакции образец может быть загрязнен — возможно «ложное срабатывание». Оценивать результаты реакции должен практический врач, который лечит конкретного больного. Дело в том, что далеко не всегда положительный ответ теста означает наличие заболевания. Например, человек пролечился от какого-либо заболевания, но погибший и уже не опасный возбудитель будет еще некоторое время «разбираться на запчасти» защитной системой организма. Если в этот момент сделать ПЦР — результат окажется положительным. Другой вариант — это отрицательный результат ПЦР при наличии даже явной клинической картины. Одна из наиболее возможных причин — материал для исследования был взят «не оттуда». Образец должен брать квалифицированный врач, строго следуя инструкции, которую ему дает лаборатория.
Результаты ПЦР диагностики
Диагностику следует отложить при повышении температуры. Что показывает тест на антитела? Наличие иммуноглобулинов означает, что пациент либо болеет сейчас, либо переболел коронавирусом недавно. Если антитела отсутствуют, он либо не заражался никогда, либо микроорганизм попал в тело совсем недавно. Иммунный ответ формируется до двух недель. Данное исследование не стоит воспринимать как пробу на коронавирус. Если антитела к нему есть, значит, контакт с возбудителем был. Но их отсутствие нельзя однозначно трактовать как избегание вируса. Наличие антител и прививки Положительный результат описанного исследования еще не гарантирует невозможность повторного заражения.
Иммунитет формируется ориентировочно на полгода. Поэтому в регионах, где установлены ограничения, QR-коды выдаются не только привитым, но и переболевшим в течение последних шести месяцев. Однако присутствие иммуноглобулинов не отменяет необходимость вакцинации. Вопреки распространенному мифу, перед прививкой выяснять их количество не нужно. Дополнительная диагностика Перечисленные методы диагностики позволяют установить наличие в организме COVID-19 и иммунный ответ на него. Однако у разных людей заболевание протекает неодинаково: меняется набор симптомов, риски возникновения тех или иных осложнений. Если у выздоровевшего пациента обнаружены антитела в достаточном количестве, это позволяет ему стать донором крови для лечения тяжелых больных. Для этого ему нужно пройти стандартную диагностику во избежание передачи иных вирусов реципиентам.
Коротко обо всех методах диагностики коронавируса Мы рассмотрели возможные методы обнаружения коронавируса в организме, оценки его устойчивости к данному заболеванию. Подчеркнем, что наличие вируса и выявленные антитела к нему — не одно и то же, поэтому и показания к прохождению обследований отличаются. При появлении первых признаков ОРВИ, которую легко перепутать с коронавирусом, лучше сразу выбрать полимеразную цепную реакцию. На этом этапе важно выяснить, имеет место банальная простуда или более опасное заболевание. Иммуноглобулинов на первых этапах вообще не бывает, так что искать их нет смысла.
Лучше проводить исследование в современной, хорошо себя зарекомендовавшей лаборатории. Для получения правильного результата важна чувствительность системы диагностики. Это нужно для пациентов с невысокой вирусной нагрузкой.
Частота проведения количественного анализа Сдача анализов на гепатит с расшифровкой — надежный современный способ диагностики. Исследования проводятся до лечения, во время и после него, при наличии как острой, так и хронической форм заболевания. Диагностика, проведенная до терапии, определяет его эффективность в дальнейшем. Традиционно исследование проводят перед назначением противовирусной терапии и через три месяца после лечения. Во время лечения забор крови делают на 1-й, 4-й, 12-й и 24-й неделях. Уже на 12-й неделе показатель виремии должен значительно снизиться. Если этого не происходит, лечение неэффективно и нужно подыскивать новое.
Однако сомнительный или ложный результат может давать любая тестовая система. Эксперты неоднократно выражали мнение, что ложные результаты на коронавирус связаны связаны как с ошибками медработников, так и пациентов. Иными словами, речь идет о несоблюдении правил и рекомендаций по тестированию. Еще одну версию выдвигал директор Института медицинской паразитологии, тропических и трансмиссивных заболеваний Сеченовского университета Александр Лукашев. Газете «Известия» он рассказывал, что COVID-19 — специфический вирус в том плане, что его можно не обнаружить в доступном биоматериале. Если другие коронавирусы размножаются в носоглотке и ротоглотке, где их можно легко найти, то SARS-CoV-2 у значительной части больных присутствует только в бронхах. Вместе с этим в ВОЗ подчеркивают, что на результаты тестирования влияет очень много факторов.
Сначала с помощью компьютера в базе данных генома человека мы подбираем две маленькие строчки, между которыми должен располагаться искомый текст. С помощью специального аппарата мы выращиваем нужные цепочки ДНК из последовательности букв нуклеотидов , получаем эти маленькие строчки в виде химического вещества в пробирке, добавляем в неё необходимые реактивы, меняем температуру, и в итоге получаем нужный нам участок генома. Дальше его можно анализировать с помощью разных способов. Как анализ конкретных участков ДНК помогает в лечении онкозаболеваний? Мы постоянно ищем такие участки. Отбираем группу пациентов с похожими заболеваниями, достаточно дорогостоящими методами анализируем всю кодирующую последовательность их геномов и смотрим какие-то закономерности, к примеру, что у этой группы встречается с большей вероятностью какой-то генетический вариант. Дальше мы этот вариант будем проверять на расширенной группе больных и здоровых людей. Чтобы это сделать, мы разрабатываем ПЦР-тест, который будет «смотреть» конкретно этот вариант из всего генома, есть он у человека или нет. Если это наследственные раковые синдромы, которые мы ищем, то выделяем ДНК из крови. Также есть тесты на соматические мутации, но здесь уже используется биопсийный материал опухоли, в основном речь идет о выборе терапии, например, таргетных препаратов. Что это значит? Мы находимся только в первой половине этого пути познания и понимания. На самом деле это даже не расшифровка в буквальном смысле, а только прочитывание отдельных букв и слов, в отдельных случаях даже без понимания смысла. Мы понимаем только определенные слова — как последовательность ДНК преобразуется в последовательность белка — это и есть генетический код. Только в прошлом году произошел значимый прогресс в предсказании того в какие объемные структуры превращаются эти белковые последовательности. Этому способствовало развитие методов глубокого машинного обучения и искусственных нейронных сетей. Ученым еще предстоит много разбираться с тонкостями регуляторных участков ДНК, чтобы понимать, когда какие гены будут включаться, а когда — выключаться.
Расшифровка анализа пцр
Примером доклинической диагностики будет обследование в инкубационный период с момента заражения до возникновения жалоб больного , а также латентная инфекция когда симптомов нет совсем, а есть только лабораторные данные — ПЦР, к примеру. Одним из важных моментов ПЦР-диагностики является проведение ПЦР в архивном материале или биологических остатках, что важно для идентификации личности или отцовства. В настоящее время ПЦР-диагностика подвергается существенному развитию. Происходит совершенствование самого метода, вновь и вновь появляются новые разновидности ПЦР, на медицинский рынок поступают новые тест-системы для данной реакции. Благодаря этому стоимость ПЦР-исследований с каждым годом становится доступнее для широкого круга пациентов. В ходе исследования копируется только тот участок, который подходит под заданные условия, и только в ситуации присутствия его в исследуемой пробе. Например, материал для исследования, в котором предполагается наличие фрагментов ДНК или РНК возбудителя слюна, кровь, моча, выделения из половых органов , помещается в специальный реактор амплификатор. Далее к нему добавляются специфические ферменты, которые связываются с ДНК или РНК патогена, и происходит синтез ее копии. Это копирование идет в несколько этапов по типу «цепной реакции», и в конечном итоге из одной копии генетического материала могут образоваться сотни и тысячи копий. Затем идет анализ и сравнение результата с имеющейся базой данных о строении различных возбудителей. Посредством ПЦР можно не только выявить тип возбудителя, но и выдать количественный результат анализа, то есть как много возбудителей в организме человека.
Метод ПЦР в настоящее время расширяет круг возможностей проводимых исследований: введение мутаций, сращивание фрагментов ДНК, и получил широкое распространение в медицине, к примеру, для установления отцовства, появление новых генов и прочее. Материал для исследования и правила его забора Материалом для ПЦР-исследования, в котором можно выявить чужеродную ДНК бактерии или ДНК или РНК вируса могут служить различные биологические среды и жидкости человека: слизи, моче, крови, мокроте, соскобе эпителиальных клеток, тканях плаценты, крови, соке простаты, околоплодные воды, плевральная жидкость.
Как же все-таки интерпретировать результаты? АльфаМед расскажет Вам, что означают те или иные показатели и поможет разобраться! ПЦР-тест необходимо сдавать для установления факта заболевания коронавирусом.
Этот вариант диагностики позволяет обнаружить вирус на его начальной стадии, даже если у пациента еще нет признаков и симптомов болезни. Антитела, в свою очередь, это ответная реакция организма на коронавирус. Результат теста на антитела IgG и IgM позволяет понять, на какой именно фазе заболевания находится пациент, а также помогает определить, была ли перенесена инфекция в прошлом. Если Вы хотите максимально точно определить болеете ли Вы, на какой стадии заболевания находитесь или же понять, было ли заболевание в прошлом, то лучшим вариантом будет сдача не только ПЦР-теста, но и теста на антитела.
Как расшифровываются полученные итоги, и есть ли связь между этим методом и другими способами диагностики? Диагностика позволяет поставить диагноз не только при инфекционных процессах, но и при генетических патологиях, некоторых онкологических недугах. Изначально ПЦР изобреталась не для применения в медицине. В отрасль здравоохранения метод пришел из области молекулярной биологии, в которой активно использовался после своего открытия. Ученый, создавший ПЦР, получил нобелевскую премию. Прежде чем разбираться, как расшифровывать результаты анализов ПЦР, необходимо понять, в чем основная суть методики. На самом деле на словах все выглядит довольно просто. У пациента берется биологический материал. Затем он обрабатывается особым образом с помощью специальных химических реагентов. Затем получившуюся смесь помещают в особую машину, которая проводит процесс амплификации. То есть многократного умножения определенных фрагментов ДНК или РНК, что удалось выявить с помощью добавления реагентов. Когда процесс амплификации подойдет к концу, доктору остается только идентифицировать полученные результаты, чтобы поставить верный диагноз. Главное — проявить внимательность на этапе идентификации. Но учитывая, что сегодня большую часть работы делает компьютер, все сильно упрощается. ПЦР отличается высокой эффективностью. Ее широко применяют для того, чтобы определять наличие в организме скрытых инфекционных процессов, которые не дают положительных серологических реакций. Также скрытые инфекции обычно нельзя выявить с помощью посева или микроскопии. Поэтому зачастую ПЦР — единственный достоверный способ постановки диагноза в этом случае. Какие материалы можно использовать для ПЦР Часто удачность исследования зависит от того, как и какой материал брался для выполнения анализа. Однако в случае с полимеразной цепной реакцией расшифровка результатов ПЦР исследований мало зависит от биологического материала, который брался у пациента. Гораздо большее значение имеет подготовка к обследованию с помощью метода. В качестве материала могут служить: кровь, сдаваемая в соответствии со стандартными рекомендациями из вены на локтевом сгибе мокрота, собираемая при откашливании налет с ротовой полости, собираемый доктором в утреннее время, пока пациент еще не завтракал и не чистил зубы мазок с половых органов, дающий хорошие результаты в том случае, если больной не мочился в течение нескольких часов, отказывался от сексуальных контактов несколько дней и соблюдал ряд других рекомендаций исследование мочи, при котором биоматериал также предпочтительно собирать с утра, не проводя накануне гигиену половых органов биоптаты органов или тканей, получаемые с помощью специальных инструментов и др. Как отмечают врачи, материалом для ПЦР может быть совершенно любая жидкая среда организма человека. При выборе главное помнить о том, что предпочтение отдают той среде, где с большей долей вероятности будет присутствовать возбудитель. Например, при половых инфекциях целесообразнее брать мазок с половых органов или кровь, чем мазок из ротовой полости. Решать вопрос о том, какие материалы используются для получения результатов ПЦР в том или ином случае, лучше всего с лечащим врачом на приеме.
Такой тест не только помогает обнаружить носителя инфекции, но и вовремя выявить контактирующих. В 1993 году автор методики полимеразной цепной реакции, Кэри Мюлис, получил Нобелевскую премию по химии. Ее суть в том, что берется фрагмент ДНК в малой концентрации и значительно искусственно увеличивается при помощи ферментов. PCR считается самым чувствительным, потому что определяет наличие возбудителя и его количество, даже когда содержание минимальное. Анализ этим методом особенно актуальный при бессимптомном течении заболевания. Сдавая ПЦР тест, можно получить еще несколько преимуществ: проверить на генетическом уровне собственное здоровье; выявить вирус на ранней стадии; обнаружить другие вредоносные микроорганизмы. В основе PCR диагностики — технология инвитро in vitro. Эта методика позволяет проводить эксперимент вне живого организма — в пробирке. Желательно сразу после сна. Чем точнее выполняются предписания, тем достовернее получается результат анализа. Чтобы правильно сдать ПЦР на ковид, необходимо заранее подготовиться: За 3-4 часа до прохождения исключить: прием еды, напитков; использование капель в нос, солевых растворов и спреев; курение; чистку зубов; полоскание рта и горла. Если мучает сильная жажда, то разрешается сделать всего несколько глотков обыкновенной воды не менее, чем за 30 минут до взятия мазков. За 12 часов до сдачи исключить: леденцы для рассасывания;.
Азбука жизни. Зачем в онкологии нужны ПЦР-тесты и какую информацию о болезни хранит в себе ДНК
метод применяется в медицине, биологии, ветеринарии, криминалистике, санитарной службе и других отраслях деятельности человека. Подробное описание: что такое ПЦР-тест на ковид, что показывает и как узнать результат. Как проводится забор биоматериала, как подготовиться. ПЦР-тест или полимеразная цепная реакция – метод молекулярно-генетического исследования, указывающий на наличие или отсутствие инфекции в организме больного. ПЦР или полимеразная цепная реакция является золотым стандартом в диагностике многих инфекций.
ПЦР-тест и тест на антитела к коронавирусу: как разобраться в результатах?
Тесты на ВПЧ могут быть качественными (простой ПЦР) и количественными (Digene test, ПЦР), они предназначены для выявления некоторых типов папилломавирусов. HCV, РНК [реал-тайм ПЦР]: описание, синонимы, методы исследования, какой биоматериал можно использовать, как правильно подготовиться, для чего используется, когда назначается, что означают результаты. Анализ методом ПЦР позволяет обнаружить возбудителя заболевания, присутствующего в организме даже в минимальных количествах. Метод ПЦР позволяет идентифицировать в биологическом материале искомый участок генетического материала и обнаружить единичные молекулы ДНК микроорганизмов, не выявляемые другими методами. ПЦР, или полимеразная цепная реакция, представляет собой метод обнаружения инфекций.
«Вероятность обнаружить вирус снижается». Когда нужно сдавать ПЦР-тест
Вирус поражает эпителий интимных органов, а результат его разрушительной работы обычно обнаруживает врач-гинеколог, уролог, дерматовенеролог, онколог. ВПЧ приводит к формированию остроконечных и плоских кондилом у мужчин и женщин, а также других, некондиломатозных поражений например, бовеноидного папулеза. Женщинам гинеколог часто ставит диагноз «интраэпителиальная неоплазия шейки матки». Вторая и третья степень этого заболевания считается предраковым состоянием и требует очень внимательного отношения.
Злокачественных опухоли развиваются только через много лет постоянного носительства вируса. Обычно он исчезает из организма самостоятельно или после проведенного лечения. Анализ на вирус папилломы человека сам по себе не дает основания ставить какой-либо диагноз.
Он просто фиксирует факт заражения. Опасными в плане развития рака сегодня считаются штаммы под номерами HPV 70, 68, 64, 59, 50, 39, 33, 31, 18, 16. Их называют вирусами высокого онкогенного риска ВКР.
Данные штаммы провоцируют опухоли шейки матки, вульвы, влагалища у женщин и полового члена у мужчин. В последние годы публикуется информация например, в журнале Journal of Clinical Oncology и других медицинских изданиях о связи ВПЧ с раком полости рта, горла, ануса, прямой кишки, что связывают с распространением орального и анального секса, в том числе среди однополых партнеров. Пик заражения ВПЧ всегда приходится на начало активной половой жизни, а вот риск развития рака повышается с возрастом и накопленными болезнями.
Чем старше человек, и чем дольше он инфицирован онкогенным штаммом, тем выше опасность. Читайте также: Молочница и цистит. Связаны ли они?
Виды анализов на папилломавирус Карцинома шейки матки — самое распространенное заболевание, связанное с инфицированием папилломавирусом, от него до сих пор ежегодно умирает несколько сотен человек. Поэтому все женщины должны ежегодно проходить гинекологический осмотр с цитологическим мазком, а после 30 лет — сдавать анализ на ВПЧ. Бесплатно по полису ОМС такой анализ не делают.
В поликлинике по месту жительства можно выполнить только цитологический мазок. Мужчины сталкиваются с анализами, если инфицирована их партнерша партнер , поскольку лечение надо проходить одновременно, или у них самих обнаружены поражения, связанные с ВПЧ — кондиломы, болезнь Боуэна, бовеноидный папулез. Сегодня для выявления ВПЧ в организме применяется два метода молекулярной биологии: полимеразно-цепная реакция; метод гибридного захвата digene-test.
Существуют и другие методы, но они используются редко и не стандартизированы. И ПЦР, и дайджин-тест достаточно информативны и точны. Между ними есть сходства — оба основаны на выявлении ДНК вируса в клетках эпителия человека, биоматериал для анализа берется одинаково.
Различия состоят в способах обработки материала и получения результата. Что такое полимеразно-цепная реакция Прогрессивная методика, разработка которой продвинула вперед многие области науки, в том числе медицины. Метод основан на многократном умножении отдельных фрагментов ДНК в полученном клеточном материале.
Для выполнения анализа на папилломавирус используется специальный прибор-аплификатор. К ней добавляют вещества-праймеры, и полученная смесь охлаждается. После этого в смесь добавляется фермент ДНК-полимераза и нуклеотиды.
Смесь снова нагревается до температуры 37 градусов, при которой будет происходить нужная реакция. Если искомая последовательность присутствует в материале совпадает с добавленным праймером , то нуклеотиды присоединяются к концам праймеров, и участок ДНК удваивается путем естественной репликации. Затем процесс повторяется многократно, до накопления требуемого количества фрагментов, которые удается распознать.
Таким образом можно выявить даже единичный вирус или бактерию в организме, поэтому метод очень точный.
Диагностика, проведенная до терапии, определяет его эффективность в дальнейшем. Традиционно исследование проводят перед назначением противовирусной терапии и через три месяца после лечения. Во время лечения забор крови делают на 1-й, 4-й, 12-й и 24-й неделях. Уже на 12-й неделе показатель виремии должен значительно снизиться. Если этого не происходит, лечение неэффективно и нужно подыскивать новое.
Например, с 1 млн МЕ нагрузка должна уменьшиться до 100 тыс. После окончания лечения проводят расшифровку анализа гепатита С для исключения рецидивов. Заключение Cтоимость проведения исследования для пациентов при отсутствии страховых случаев колеблется в пределах от 500 до 5 000 руб. Такой разброс цен вызван качеством реактивов. Набирает популярность метод ТМА транскрипционная амплификация , известный пока только за пределами России.
Скажем, из трех миллиардов букв ДНК выделяем только триста, и уже с ними работаем. В пробирке мы можем создать такую функцию, которую можно сравнить с поиском текста в компьютере. Сначала с помощью компьютера в базе данных генома человека мы подбираем две маленькие строчки, между которыми должен располагаться искомый текст. С помощью специального аппарата мы выращиваем нужные цепочки ДНК из последовательности букв нуклеотидов , получаем эти маленькие строчки в виде химического вещества в пробирке, добавляем в неё необходимые реактивы, меняем температуру, и в итоге получаем нужный нам участок генома. Дальше его можно анализировать с помощью разных способов. Как анализ конкретных участков ДНК помогает в лечении онкозаболеваний? Мы постоянно ищем такие участки. Отбираем группу пациентов с похожими заболеваниями, достаточно дорогостоящими методами анализируем всю кодирующую последовательность их геномов и смотрим какие-то закономерности, к примеру, что у этой группы встречается с большей вероятностью какой-то генетический вариант. Дальше мы этот вариант будем проверять на расширенной группе больных и здоровых людей. Чтобы это сделать, мы разрабатываем ПЦР-тест, который будет «смотреть» конкретно этот вариант из всего генома, есть он у человека или нет. Если это наследственные раковые синдромы, которые мы ищем, то выделяем ДНК из крови. Также есть тесты на соматические мутации, но здесь уже используется биопсийный материал опухоли, в основном речь идет о выборе терапии, например, таргетных препаратов. Что это значит? Мы находимся только в первой половине этого пути познания и понимания. На самом деле это даже не расшифровка в буквальном смысле, а только прочитывание отдельных букв и слов, в отдельных случаях даже без понимания смысла. Мы понимаем только определенные слова — как последовательность ДНК преобразуется в последовательность белка — это и есть генетический код. Только в прошлом году произошел значимый прогресс в предсказании того в какие объемные структуры превращаются эти белковые последовательности.
Диагностика латентных инфекций. ПЦР-диагностика определяет возбудителя инфекции даже в инкубационном периоде и при скрытом течении заболевания. Какие есть недостатки Единственный серьезный недостаток, связанный с методом полимеразной цепной реакции, - его высокая технологичность. Исследования ПЦР требуют строжайших соблюдений правил и серьезной оснащенности лабораторного комплекса. Не каждая лаборатория может позволить себе все необходимое оборудование. Урогинекология диагностика инфекций, передающихся половым путем: хламидиоз, уреаплазма, микоплазма, кандиды, гарднерелла, герпесвирусы. Важное значение для женского и мужского здоровья играет ВПЧ — вирус папилломы человека. Доказано, что у женщин онкогенные штаммы этого вируса способны вызывать рак шейки матки. Существует целый ряд инфекций, способных поражать плод еще в материнской утробе. Среди них вирусы герпеса, токсоплазмы, краснухи. ПЦР-диагностика позволяет правильно определить тактику ведения и риски внутриутробной инфекции. Респираторные заболевания. Диагностика методом ПЦР стала в 2020 году актуальной как никогда и продемонстрировала свою незаменимость и эффективность. ПЦР-анализ — главный тест и «золотой стандарт» диагностики коронавирусной инфекции Sars-Cov-2 COVID-19 , ставшей причиной самой масштабной пандемии последних десятилетий. Наследственные заболевания и отцовство также диагностируются при помощи метода ПЦР. ПЦР-тесты применяются везде, где нужен быстрый, точный и надежный результат. Подготовка к проведению ПЦР-теста Еще одно немаловажное преимущество ПЦР-анализов — это отсутствие специфической подготовки к проведению тестов.