Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – это современный инструмент диагностики разнообразных инфекций, отличающийся высокой точностью.
Что еще почитать
- ПЦР-тест (мазок) на коронавирус или сдать кровь на антитела - какой тест лучше? | VMedic
- ПЦР тест на коронавирус: что это и как проводится диагностика
- Ложноположительный ПЦР: Почему так бывает?
- Как определить коронавирус или что такое анализ ПЦР?
- ПЦР-диагностика: что это такое?
Какую информацию дает тест на антитела
- Что такое ПЦР тест на коронавирус и как правильно сдавать мазок
- Что такое анализ ПЦР? - статья лаборатории ДНКОМ
- Что такое ПЦР, и с чем её едят | Пикабу
- ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео) - Симптомы и лечение. Журнал Медикал
- ПЦР-диагностика
- Что выбрать: ПЦР-тест или тест на антитела к COVID-19?
ПЦР-диагностика
Полимеразная цепная реакция, ПЦР (англ. Выводы. Полимеразная цепная реакция (ПЦР, PCR), открытая американцем Кэрри Муллисом в 1983 году, и метод детекции ДНК, разработанный на ее основе, принесли ученому Нобелевскую премию по химии 1993 года. Сделав антигенный экспресс-тест, а иногда не один, и получив положительный результат, многие пытаются подтвердить диагноз в лаборатории с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Записаться на прием
- ПЦР диагностика: что это такое
- Диагностика методом ПЦР: современный подход выявления инфекционных и генетических заболеваний
- Положительный ПЦР-тест на коронавирус после выздоровления, как правило, не опасен
- ПЦР диагностика - анализ на инфекции (+ видео)
Результаты ПЦР диагностики
Кровь анализируется на лейкопению снижение числа лейкоцитов , лимфопению уменьшение количества лимфоцитов , тромбоцитопению недостаток тромбоцитов. Биохимический анализ крови. Такой метод позволяет оценить состояние внутренних органов, на которые влияет новая инфекция. Производится лабораторная диагностика печеночных ферментов электролитов, мочевины, билирубина, альбумина и глюкозы. Анализ этих показателей помогает определить, есть ли функциональные отклонения в организме, и правильно назначить лечение, учитывая выявленные нарушения. Эта диагностическая процедура призвана оценить уровень кислорода в крови. Плюс метода в том, что цельность кожного покрова не нарушается. Замер происходит с помощью прибора пульсоксиметра. Анализ уровня CRP. Этот маркер наличия коронавирусной инфекции показывает количество С-реактивного белка в организме.
Исследования доказали, что его концентрация значительно повышается при ковидном заболевании. Такие показатели наблюдались при тяжелой и легкой форме течении инфекции. Анализ можно делать уже в первые дни заражения, потому что концентрация С-реактивного белка повышается спустя 6—8 часов от момента инфицирования.
Если результат положительный — его повторяют, и только в случае двойного положительного результата пациенту сообщают о болезни. Анна Солдатова.
Например, впервые ПЦР была использована таким образом для диагностики серповидно-клеточной анемии путем обнаружения мутации одного гена. Как проводится ПЦР-анализ Метод полимеразно-цепной реакции постоянно развивается. Самым распространенным на сегодня является тест в реальном времени, с помощью которого можно определить исходное количество копий ДНК РНК. ПЦР с вложенной парой праймеров гнездовая проводится в две стадии для снижения вероятности амплификации неспецифичных участков ДНК. Инвертированная ПЦР используется в случае, когда нужно выяснить природу неизвестных участков ДНК, окружающих известный. Это только часть методов ПЦР, количество которых постоянно пополняется новыми технологичными вариантами. Для проведения анализа биоматериала с помощью ПЦР необходимо обеспечить его правильное взятие. При взятии мазка из носоглотки или ротоглотки образец биоматериала собирают путем введения длинного зонда-тампона в ноздрю или в заднюю часть горла. Во время анализа крови медицинский работник возьмет образец из вены на руке с помощью небольшой иглы. Количественный ПЦР в реальном времени позволяет также оценить инфекционную нагрузку, а также определить момент, когда условно-патогенные микроорганизмы стали патогенными в результате неконтролируемого роста. Список источников Mousa G. Ghannam; Matthew Varacallo.
Там подчеркнули, что вырастает шанс получить такой результат у больного COVID-19 после четвертого-пятого дня болезни. При заражении COVID-19 у больного отсутствуют специфические признаки, которые характерны только для этой инфекции. Наиболее часто заразившийся сталкивается с респираторными симптомами, что может говорить не только о коронавирусе, но и ряде других заболеваний, включая грипп и ОРВИ. По этой причине единственным способом диагностики коронавируса остается ПЦР-тестирование. В частности, тогда считалось, что в большей части случаев на это влияют ошибки при заборе материала и качество самого теста. Тем не менее существует и другое обоснование. По словам заместителя директора по клинико-аналитической работе ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора профессора Натальи Пшеничной, на результате анализа сказывается период заболевания, в который заболевший сдает ПЦР-тест.
О видах исследований на новую коронавирусную инфекцию COVID-19
Что делать, если пришел положительный результат анализа COVID-19 О результатах проведенного тестирования пациент может узнать из электронного письма, СМС-сообщения или зайти на сайт клиники, где будут выложены данные. На результаты тестирования и последующие действия влияют два фактора: 1. Метод, с помощью которого был проведен лабораторный анализ. На сегодняшний день золотым стандартом в диагностике коронавирусной инфекции является ПЦР-тест. Дополнительным методом диагностики является иммуноферментный анализ, позволяющий определить наличие в крови антител, вырабатываемых иммунитетом к конкретному возбудителю. Если результаты ПЦР-диагностики положительные, это говорит о том, что человек на данный момент болен и является носителем инфекции, распространяя ее на окружающих. Самочувствие пациента. Если анализ теста на коронавирус положительный, но самочувствие пациента нормальное, он все равно является носителем COVID-19. Поэтому чтобы инфекция не распространялась, человек должен строго соблюдать правила двухнедельной самоизоляции. В этом случае прекращаются все контакты с посторонними людьми.
В случае сочетания положительного теста с выраженными симптомами коронавируса мучительный кашель, высокая температура, потеря вкуса и обоняния , пациент может нуждаться в госпитализации. В некоторых случаях инфекция, попавшая в организм, вызывает тяжелые осложнения: вирусную пневмонию, сердечную и легочную недостаточность, расстройства в работе печени, почек, головного мозга. В таких ситуациях больной нуждается в постоянном медицинском наблюдении и специальном лечении, которое возможно осуществить только в условиях стационара. В любом случае, если человек получил положительный тест на COVID-19, что предпринимать дальше самостоятельно он не решает.
На эти и другие вопросы отвечает Владислав Александрович Чередниченко, врач-инфекционист, заместитель директора по развитию «Клиника Эксперт» Воронеж. Севиля Ибраимова 13 ноября 2019 Перечень анализов, проводимых при помощи ПЦР-диагностики расширяется с каждым днём. ПЦР или, иначе, полимеразная цепная реакция — это современный высокоинформативный метод молекулярно-генетической диагностики, активно применяемый для выявления у человека различных инфекционных и наследственных заболеваний.
Официальной датой изобретения этого метода диагностики считают 1983 год, а «родителем» - американского биохимика Кэри Муллиса. Он хотел создать метод, благодаря которому можно было бы амплифицировать ДНК увеличивать число её копий в ходе многократных последовательных удвоений исходной молекулы ДНК с помощью фермента ДНК-полимеразы.
Когда разрушенные участки генетического материала уже погибшего возбудителя еще сохраняются в крови или биологических средах. Результат становится отрицательным по истечении шести-девяти месяцев после терапии. Какой врач проводит расшифровку ПЦР-исследований Первично назначается анализ либо венерологом, либо урологом, либо гинекологом для женщин.
Оценка анализа и выставление результатов в бланке ответа — это функция врача-лаборанта, проводившего исследование. Дальнейшая интерпретация полученных данных — это функционал узкого специалиста, к которому обращается пациент. Врач назначает такие исследования обычно при: признаках острого воспаления урогенитального тракта, для уточнения причины воспаления, перед планируемой беременностью или эко, у беременных с отягощенной акушерской историей, для контроля эффекта от проводимого лечения по поводу вензаболевания не раньше, чем спустя месяц после окончания терапии , в качестве скрининга для исключения бессимптомного течения инфекции при наличии более одного партнера за год. Методы молекулярной биологии имеют важное от культуральных или серологических методик отличие. Они не требуют определенного накопления возбудителя или антител к нему и чувствительны практически сразу от момента заражения.
Нет смысла выдерживать паузу в течение предполагаемого инкубационного периода венерической инфекции. Анализ можно сдавать сразу после того, как возникли подозрения о возможном заражении или развитии инфекционного агента.
Инструкция по использованию контейнера Открутите крышку контейнера и положите её, не касаясь внутренней части крышки. Соберите первую порцию мочи в контейнер. Если мочу на анализ берут у ребёнка, можно использовать мочеприёмник. Закройте контейнер крышкой и плотно закрутите её. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в течение 2 часов после взятия биоматериала. Подготовка к ПЦР-анализу кала Кал следует сдавать до приёма антибиотиков или не ранее, чем через 12 часов после приёма препарата.
За 72 часа до исследования откажитесь от использования ректальных свечей и масел, слабительных средств и клизм, а также прекратите приём препаратов, оказывающих влияние на работу кишечника и окраску кала. Соберите образец кала после естественного опорожнения кишечника без применения клизм или слабительных средств. Позаботьтесь о том, чтобы в биоматериал не попали посторонние примеси: вода, моча, выделения половых органов, дезинфицирующие средства и химические вещества, содержащиеся в подгузниках: перед дефекацией вымойте и высушите промежность; соберите кал с чистой и не впитывающей влагу поверхности: это может быть чистый пакет из полиэтилена, клеёнка, чистое судно или горшок. Собирать кал из унитаза, пелёнок или подгузников — нельзя! Поместите 1—2 чайные ложки биоматериала в герметичный контейнер. Если нужно выполнить несколько анализов, подготовьте для каждого исследования отдельную порцию биоматериала в отдельном контейнере. Доставьте контейнер в лабораторное отделение в течение 2 часов после сбора.
ПЦР-исследования
Расшифровка этих анализов зависит от их результатов, которые могут быть следующими: ПЦР положительный на фоне роста активности антител IgM. Указывает на активный инфекционный процесс, вызванный выявленным возбудителем. Анализ ПЦР положительный с отсутствием антител к возбудителю. Указывает на совсем недавнее инфицирование обычно менее 3-4 недель , при котором организм человека еще не выработал иммунный ответ. ПЦР отрицательный, антитела — положительные. Такой результат свидетельствует о перенесенном в прошлом инфекционном процессе. При этом возбудителя в организме уже нет, а антитела являются защитным фактором в случае возможного повторного заражения в будущем. После перенесенной инфекционной патологии в крови длительное время циркулируют антитела класса IgG, а антитела острого инфекционного процесса класса IgM отсутствуют. С помощью такой комбинации исследований есть возможность: A.
Данная комбинация исследований также позволяет определить давность инфицирования микроорганизмом ПЦР: повторный анализ Как только пациентом будет пройден назначенный курс приема медикаментов — необходимо отправиться на повторный ПЦР анализ. Контрольный анализ позволит понять: Правильно ли подобрали антибиотик некоторые инфекции чувствительны к антибиотикам Вылечен ли пациент Если контрольный ПЦР анализ отрицательный — пациент здоров. ПЦР: повторный анализ положительный Важно! С целью контроля лечения не применяют обычный или качественный ПЦР. Это связано с тем, что частички микроорганизмов, уже безопасные, продолжают циркулировать в крови больного. Именно поэтому, повторный анализ ПЦР может быть положительным. Когда нужно проследить результат, врач назначает количественный ПЦР. Такой анализ покажет, насколько эффективным было лечение.
Повторный анализ ПЦР может быть положительным, если пациент не соблюдал рекомендации врача: Закончил прием антибиотиков раньше срока Не принимал все препараты, прописанные врачом Сдача анализов выполнена раньше, чем через месяц после пропития антибиотиков Врач подобрал неэффективный курс лечения Когда повторный ПЦР анализ на наличие инфекций положительный — назначается новое лечение. Прописываются другие антибиотики, возможно совмещение нескольких антибиотиков. Венеролог или гинеколог порекомендует вам медицинское учреждение, где можно сдать анализы методом ПЦР.
Некоторые традиционные методы, такие как иммуноферментный анализ ИФА , выделяют только белки-маркеры, которые являются продуктом жизнедеятельности возбудителей инфекции, а потому только косвенно указывают на присутствие микроорганизмов.
Наличие специфического участка в ДНК, выявленное с помощью ПЦР, безошибочно или почти безошибочно указывает на присутствие конкретной инфекции. Высокая специфичность метода. Она обусловлена тем, что в исследуемом материале выявляется фрагмент ДНК, характерный только для конкретного возбудителя инфекции. Специфичность исключает возможность ложных результатов анализа, тогда как в иммунологических методах исследований ошибки вполне вероятны из-за перекрестной реакции антигенов.
Высокая чувствительность. При помощи ПЦР-диагностики можно выявить присутствие в организме даже единичных клеток вирусов или бактерий в тех случаях, когда обычными методами сделать это практически невозможно. ПРЦ определяет наличие всего 10—100 клеток в пробе, тогда как иммунологическими и микроскопическими тестами можно определить наличие инфекции при количестве клеток не менее 103—105. Сходство состава всех ДНК или РНК дает возможность применять универсальные методы лабораторных исследований, диагностируя сразу несколько возбудителей из одной биологической пробы.
Скорость получения результатов. Поскольку для проведения ПЦР-диагностики не нужен посев и выделение культуры возбудителя, то и большого количества времени на нее не требуется. Весь цикл — от забора биоматериала до получения результатов — занимает 4—5 часов. Диагностика латентных инфекций.
ПЦР-методом диагностируются трудно культивируемые и некультивируемые формы микроорганизмов, встречающиеся в тех случаях, когда заболевание протекает в скрытой форме. Методом ПЦР можно выявлять возбудителей инфекции не только в организме человека, но и в почве, воде, продуктах питания. Ограничения метода Тем не менее не стоит думать, что ПЦР-диагностика не имеет недостатков. У нее есть свои ограничения, но их количество настолько незначительно, что не может отрицательно повлиять на популярность и эффективность метода: Вероятность амплификации ДНК не только живого, но и погибшего микроорганизма.
При проведении ПЦР-диагностики для контроля эффективности лечения необходимо соблюдать определенные требования. В частности, проводить ПЦР нужно после определенного промежутка времени 1—2 месяца , за который происходит полное исчезновение возбудителя инфекции в организме. Возможность возникновения перекрестной реакции. Подбор фрагментов ДНК праймеров осуществляется на основе знаний о генетическом строении конкретного микроорганизма.
Но теоретически такой же фрагмент может присутствовать и у других микроорганизмов, геном которых на сегодняшний день еще не расшифрован. Их присутствие в пробе может привести к ложноположительному результату анализа. Изменчивость микроорганизмов. Эта способность возбудителей к мутации иногда приводит к тому, что некоторые их штаммы становятся неуловимыми в процессе ПЦР-анализа.
Чтобы уменьшить риски, разработаны стандарты объемов испытаний тест-систем ПЦР-диагностики, включающие проверку на перекрестные реакции и тестирование всех известных штаммов конкретного возбудителя. Забор биоматериала.
Если результат положительный — его повторяют, и только в случае двойного положительного результата пациенту сообщают о болезни. Анна Солдатова.
В связи с этим иммунолог поддержал решение Минздрава РФ, согласно которому граждане с 21 февраля смогут получить сертификат при наличии антител к коронавирусу.
Ранее в четверг в федеральном оперативном штабе по борьбе с коронавирусом сообщили, что диагноз COVID-19 специалисты теперь смогут поставить по результатам экспресс-теста. Подтверждать его результат ПЦР-тестом больше не нужно. В конце января правительство России в своем Telegram-канале сообщило, что результаты экспресс-тестов будут доступны на сайте госуслуг. В конце декабря прошлого года глава Роспотребнадзора Анна Попова на неформальной встрече руководителей государств — участников СНГ заявила , что Россия занимает лидирующие места по охвату тестирования на коронавирус.
ПЦР-исследования
Затем особый фермент полимераза достраивает на каждой из двух цепочек вторую, получается две молекулы ДНК. Далее с каждой из них повторяют аналогичную процедуру. С каждым повтором число ДНК увеличивается в геометрической прогрессии, вдвое. Вооружившись калькулятором, можно посчитать, что после 30—40 повторов реакции а именно такое количество является стандартом во время исследования получится больше миллиарда копий ДНК.
Полученные на каждом этапе молекулы сразу же используются как матрицы для синтеза новых копий — и поэтому реакция называется цепной. Для чего применяют анализы ПЦР в медицине? По сравнению с другими лабораторными методами диагностики, ПЦР имеет некоторые преимущества: Высокая чувствительность.
Метод сработает, если в материале присутствует хотя бы несколько молекул ДНК. Можно исследовать не только биологические жидкости кровь, мочу и ткани организма, но и воду, землю. Высокая специфичность.
Метод может со стопроцентной вероятностью указать на конкретного возбудителя, потому что весь миллиард полученных ДНК — точные копии той самой первой, которая изначально присутствовала в материале. Можно исследовать гены людей, любых микробов, животных, растений. В одном и том же материале можно изучать разные виды ДНК.
На заметку ПЦР-диагностика используется в криминалистике для определения принадлежности найденного на месте преступления биоматериала, а также в экспериментальной медицине, создании генетических паспортов, мониторинге состояния окружающей среды, анализе продуктов питания, фармакологии, ветеринарии. Преимущества ПЦР-диагностики Хотя ПЦР-диагностика и является относительно «молодым» методом, широкое распространение в медицинской практике она получила благодаря явным преимуществам перед другими способами анализа: Прямое определение возбудителя инфекции. Некоторые традиционные методы, такие как иммуноферментный анализ ИФА , выделяют только белки-маркеры, которые являются продуктом жизнедеятельности возбудителей инфекции, а потому только косвенно указывают на присутствие микроорганизмов. Наличие специфического участка в ДНК, выявленное с помощью ПЦР, безошибочно или почти безошибочно указывает на присутствие конкретной инфекции. Высокая специфичность метода. Она обусловлена тем, что в исследуемом материале выявляется фрагмент ДНК, характерный только для конкретного возбудителя инфекции. Специфичность исключает возможность ложных результатов анализа, тогда как в иммунологических методах исследований ошибки вполне вероятны из-за перекрестной реакции антигенов. Высокая чувствительность. При помощи ПЦР-диагностики можно выявить присутствие в организме даже единичных клеток вирусов или бактерий в тех случаях, когда обычными методами сделать это практически невозможно.
ПРЦ определяет наличие всего 10—100 клеток в пробе, тогда как иммунологическими и микроскопическими тестами можно определить наличие инфекции при количестве клеток не менее 103—105. Сходство состава всех ДНК или РНК дает возможность применять универсальные методы лабораторных исследований, диагностируя сразу несколько возбудителей из одной биологической пробы. Скорость получения результатов. Поскольку для проведения ПЦР-диагностики не нужен посев и выделение культуры возбудителя, то и большого количества времени на нее не требуется. Весь цикл — от забора биоматериала до получения результатов — занимает 4—5 часов. Диагностика латентных инфекций. ПЦР-методом диагностируются трудно культивируемые и некультивируемые формы микроорганизмов, встречающиеся в тех случаях, когда заболевание протекает в скрытой форме. Методом ПЦР можно выявлять возбудителей инфекции не только в организме человека, но и в почве, воде, продуктах питания. Ограничения метода Тем не менее не стоит думать, что ПЦР-диагностика не имеет недостатков.
У нее есть свои ограничения, но их количество настолько незначительно, что не может отрицательно повлиять на популярность и эффективность метода: Вероятность амплификации ДНК не только живого, но и погибшего микроорганизма. При проведении ПЦР-диагностики для контроля эффективности лечения необходимо соблюдать определенные требования. В частности, проводить ПЦР нужно после определенного промежутка времени 1—2 месяца , за который происходит полное исчезновение возбудителя инфекции в организме. Возможность возникновения перекрестной реакции. Подбор фрагментов ДНК праймеров осуществляется на основе знаний о генетическом строении конкретного микроорганизма. Но теоретически такой же фрагмент может присутствовать и у других микроорганизмов, геном которых на сегодняшний день еще не расшифрован. Их присутствие в пробе может привести к ложноположительному результату анализа. Изменчивость микроорганизмов. Эта способность возбудителей к мутации иногда приводит к тому, что некоторые их штаммы становятся неуловимыми в процессе ПЦР-анализа.
Его проводят при обнаружении в крови антител к гепатиту. Страдает не только печень, но и соседние органы Преимущества ПЦР При исследовании методом ПЦР и расшифровке анализа крови на гепатит можно также определить генотип возбудителя заболевания. Всего существует 6 генотипов вируса и большое количество субтипов, однако в нашем регионе распространение получили 1, 2 и 3 генотипы.
Другими преимуществами данного вида диагностики являются: высокая точность полученных показателей и низкая вероятность ошибки в них; высокий уровень чувствительности к вирусным частицам в крови; возможность выявления сразу нескольких возбудителей; диагностика болезнетворных внутриклеточных микроорганизмов, обладающих высокой антигенной изменчивостью; работа с расшифровкой анализа на гепатит позволяет обнаружить скрытые текущие инфекции. Кому назначают Анализ ПЦР на гепатит обязательно сдают следующие категории людей: беременные женщины; потенциальные доноры крови и органов; те, кто имеют характерные признаки заболевания; ВИЧ-инфицированные лица; лица, ведущие беспорядочную половую жизнь. Планируя ребенка, необходимо сделать анализ на гепатит Как проводится анализ и требуется ли к нему подготовка Забор крови для ПЦР-исследования производится из вены.
Как правило, это происходит утром до того, как человек поел, поскольку после приема пищи должно пройти минимум 8 часов. В крайних случаях кровь могут взять на исследование днем или вечером, но временной зазор между анализом и приемом пищи должен составлять не менее 5 часов. Качество биоматериала для анализа будет соответствующим при следовании пациентом следующим правилам: перед сдачей крови можно пить только чистую воду; за двое суток до проведения исследования нужно отказаться от приема жареной и жирной пищи, а также алкогольных напитков; за сутки до посещения лаборатории следует прекратить прием лекарственных средств.
В случае если это не представляется возможным, об этом в обязательном порядке необходимо предупредить лаборанта и лечащего врача; накануне нужно избегать стрессовых ситуаций и физических нагрузок; не следует проходить ультразвуковое, рентгенологическое и инструментальное исследования незадолго до сдачи крови; в течение часа до анализа необходимо воздержаться от курения; за 20 минут до сдачи крови нужно отвлечься, успокоиться и выровнять дыхание. Если исследование проходит ребенок до 5 лет, родители должны проследить, чтобы он пил кипяченую воду каждые 10 минут в течение получаса до забора биоматериала. Читайте также: Секрет простаты: как берут анализ Расшифровка полученных данных Расшифровка анализа может быть представлена словами в случае качественного исследования , например, «не обнаружено» или «ниже диапазона изменений».
Служба крови. Чтобы избежать риска переливания, пациентам инфицированной опасными заболеваниями крови или плазмы ВИЧ, сифилис, гепатиты также используется метод ПЦР. Он значительно превосходит по точности серологические методы, поскольку способен выделить даже те инфекции, которые имеют длительный инкубационный период и не определяются при помощи обычных исследований в течение первых нескольких недель. Клиника инфекционных заболеваний. К ним относятся вирус гепатита, СПИД, сальмонеллез, хеликобактериоз, холера, бруцеллез, туляремия, дифтерия, токсоплазмоз и другие инфекции. Фтизиатрия и пульмонология. ПЦР-диагностика позволяет выявить возбудителей атипичных пневмоний и рецидивирующих хронических бронхитов, которыми являются хламидии и микоплазмы. Кроме того, с ее помощью можно не только поставить диагноз, но и провести видовую идентификацию возбудителя, то есть выявить конкретный штамм. Метод ПЦР используется также для ранней и высокоточной диагностики туберкулеза.
На заметку ПЦР-диагностика используется в криминалистике для определения принадлежности найденного на месте преступления биоматериала, а также в экспериментальной медицине, создании генетических паспортов, мониторинге состояния окружающей среды, анализе продуктов питания, фармакологии, ветеринарии. Преимущества ПЦР-диагностики Хотя ПЦР-диагностика и является относительно «молодым» методом, широкое распространение в медицинской практике она получила благодаря явным преимуществам перед другими способами анализа: Прямое определение возбудителя инфекции. Некоторые традиционные методы, такие как иммуноферментный анализ ИФА , выделяют только белки-маркеры, которые являются продуктом жизнедеятельности возбудителей инфекции, а потому только косвенно указывают на присутствие микроорганизмов. Наличие специфического участка в ДНК, выявленное с помощью ПЦР, безошибочно или почти безошибочно указывает на присутствие конкретной инфекции. Высокая специфичность метода. Она обусловлена тем, что в исследуемом материале выявляется фрагмент ДНК, характерный только для конкретного возбудителя инфекции. Специфичность исключает возможность ложных результатов анализа, тогда как в иммунологических методах исследований ошибки вполне вероятны из-за перекрестной реакции антигенов. Высокая чувствительность. При помощи ПЦР-диагностики можно выявить присутствие в организме даже единичных клеток вирусов или бактерий в тех случаях, когда обычными методами сделать это практически невозможно.
ПРЦ определяет наличие всего 10—100 клеток в пробе, тогда как иммунологическими и микроскопическими тестами можно определить наличие инфекции при количестве клеток не менее 103—105. Сходство состава всех ДНК или РНК дает возможность применять универсальные методы лабораторных исследований, диагностируя сразу несколько возбудителей из одной биологической пробы. Скорость получения результатов. Поскольку для проведения ПЦР-диагностики не нужен посев и выделение культуры возбудителя, то и большого количества времени на нее не требуется. Весь цикл — от забора биоматериала до получения результатов — занимает 4—5 часов. Диагностика латентных инфекций. ПЦР-методом диагностируются трудно культивируемые и некультивируемые формы микроорганизмов, встречающиеся в тех случаях, когда заболевание протекает в скрытой форме. Методом ПЦР можно выявлять возбудителей инфекции не только в организме человека, но и в почве, воде, продуктах питания. Ограничения метода Тем не менее не стоит думать, что ПЦР-диагностика не имеет недостатков.
Различие тестов на коронавирус
это крайне чувствительная вещь, то он не отличает живой вирус от мертвого. читайте в медицинском журнале клиники Адмиралтейские Верфи. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — высокоточный метод диагностики заболеваний, основанный на копировании ДНК или РНК патогена в пробе. Содержание. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) – молекулярно-генетический анализ. Чаще всего ПЦР-тест показывает ложноположительный результат из-за наличия в носу или ротоглотке фрагментов уже погибшего вируса, рассказал в интервью Лайфу доктор медицинских наук, практикующий врач, профессор Антон Ершов.
Различие тестов на коронавирус
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) — метод молекулярной биологии. В результате известные фрагменты оказываются на обоих концах неизвестного участка, после чего можно проводить ПЦР как обычно. ПЦР (полимеразная цепная реакция) на гепатит С — определяет причину появления РНК вируса в организме человека. ПЦР (полимеразная цепная реакция) – достижение молекулярной биологии, одна из главных методик клинической лабораторной диагностики конца 20-го и начала 21-го веков, приносящая огромную пользу в различных областях медицинской науки. Подробное описание: что такое ПЦР-тест на ковид, что показывает и как узнать результат. Как проводится забор биоматериала, как подготовиться.
Что такое анализ ПЦР?
В это время человек все еще является разносчиком инфекции, даже если у него нет никаких симптомов; присутствие IgM в небольшом количестве в сочетании с IgG указывает на завершение болезни. Иммуноглобулин типа G производится в острой стадии и остается в крови после выздоровления, обеспечивая иммунитет длительное время. Если тест показал наличие антител к коронавирусу типа IgG, значит у вас уже есть иммунитет к данному заболеванию и вы не представляете опасности для окружающих. Небольшое количество иммуноглобулинов свидетельствует о том, что вы переболели недавно. Какой тест сдавать? Оба варианта тестов являются эффективными, но в большинстве случаев мы рекомендуем делать тест на антитела, так как он более универсальный. Быстрее - Сейчас в лабораториях большие очереди по ПЦР-тестам и результатов можно ждать от 3 до 5 дней. По антитела результаты будут готово в течение 3-х дней.
Доступность - ПЦР-тест стоит дороже, так как тест-системы более дорогие. ПЦР-тест необходим для того, чтобы выявить инфекцию на ранней стадии, до развития иммунного ответа. Его рекомендуют делать в тех случаях, когда тест на антитела дал отрицательный или неоднозначный результат. Если вам трудно определиться с выбором и вы хотите получить полную картину, не теряя лишнее время, то сразу делайте 2 теста.
Итак, пора переходить к решению задачи. Рассматривая поставленную выше задачу, мы уже увидели две основных проблемы на пути к её решению. Понятно, что с одной стороны, выискивать клетку возбудителя инфекции среди миллионов клеток крови — занятие достаточно бесперспективное, если не сказать бестолковое, а с другой стороны, выделять ДНК из клеток " в рукопашную" — тоже не вариант, из-за опасности порвать на кусочки, всё что мы с таким трудом отыскали… Поэтому, нам очень помог бы какой-нибудь метод, позволяющий активно размножать ДНК, но делающий это только с определёнными, "избранными" экземплярами. Это позволит увеличивать концентрацию интересующей культуры до уровней, безошибочно определяемых и не требующих длительного поиска. Вот этим чудо-методом и стал метод полимеразной цепной реакции ПЦР. Эта реакция носит название репликации ДНК. Так это звучит сухим академическим языком. Но мы задались целью, объяснить Вам всё, буквально, "на пальцах", а потому продолжим свой рассказ о том, как всё происходит. На первом этапе реакции надо разъединить двойную нить ДНК. Этот процесс называется денатурацией и проходит при температуре 93 - 95 градусов Цельсия. Уже через 30 - 40 секунд связи нуклеотидов разрываются и вместо двойной цепи получаются две одиночные. Надо заметить, что если после этого, снова, просто понизить температуру, то разделившиеся половинки достаточно быстро находят друг друга и всё возвращается, практически, к исходному состоянию. Следовательно, нам надо не дать соединиться половинкам интересующей нас ДНК. Как этому помешать? Тогда, место на половинке-основании окажется занято, при попытке присоединения, свойство комплементарности окажется нарушено, и вторая половинка не сможет прицепиться на своё "законное" место. Это "что-то" названное праймером, синтезируется в научной или промышленной лаборатории и представляет собой цепочку синтетических нуклеотидов олигонуклеотидов , расположенных в таком же порядке, как и у того вируса бактерии и так далее , на который делается анализ. Например, если делают анализ на хламидии, то праймер соответствует специфическому участку гена, кодирующего главный белок наружной мембраны МОМР Chlamydia trachomatis. Итак, вторая стадия - присоединение праймеров к ДНК также называется отжигом длится от 20 до 60 секунд. Температура отжига равна 50 - 65 градусам для каждого вида возбудителей, то есть для каждого праймера, она своя. На этом этапе мы уже разделили ДНК на две половинки и не даём им соединиться. Теперь самое время достроить каждую половинку до полноценной ДНК. Но температура, при которой это должно произойти, очень высока, по меркам молекулярной биологии — более 70 градусов выше температуры отжига. Проблема была решена благодаря открытию уникального фермента taq-ДНК-полимеразы, содержащегося у бактерий, обитающих в гейзерах. Особенность этого фермента заключается в его исключительной термостойкости период полужизни при 95 градусах составляет 40 минут и высокой рабочей температуре — оптимум работы 72градуса.
Существуют различные модификации этого метода, но цель их одна — поиск специфических участков генома вируса, присутствие которых позволяет сделать вывод, что в данном биоматериале вирус есть. Все — и азиатские врачи, и европейцы, и американцы, и мы в России и в Израиле — все работают этим методом. Отрицательный и ложноотрицательный результат Однако, отрицательный результат ПЦР-анализа, к сожалению, не говорит об обратном, не исключает наличие вируса в организме. Мы можем только говорить, что вирус не обнаружен. Не обнаружен в исследуемом биоматериале, которым чаще всего является мазок из рото- или носоглотки. Почему так происходит? Потому что вирус совсем недолго находится на слизистой верхних дыхательных путей, спускаясь в бронхи и лёгкие — мишень поражения. Поэтому лучше искать его ниже — в мокроте, выделяемой при кашле, и смывах из нижних дыхательных путей бронхоальвеолярный лаваж. Участки генома вируса способны связываться с гемом, нарушая функцию гемоглобина в эритроцитах. Это мешает транспортировке кислорода клетками крови и именно гипоксия недостаток кислорода негативно влияет на лёгкие. Влияние вируса на кровь подталкивает к мысли, что именно в ней мы можем найти SARS-Cov-2 в тяжёлых клинических случаях, хотя не обнаруживаем его на слизистых верхних дыхательных путей. Мы должны научиться выделять вирус из крови. Описана даже кишечная форма короноавируса, проявившаяся тошнотой, рвотой, диареей.
Сделать это должен: любой человек с признаками ОРВИ; член семьи пациента, у которого диагностирована коронавирусная инфекция; потенциальный контактный гражданин, который находился в общественных местах без маски или общался с больным; медработник, лечивший зараженного. ПЦР-тест проводится путем забора мазка из носоглотки. Сделать его можно в лаборатории или вызвав врача на дом. Реакцию запускают в лабораторных условиях. Результат теста: как интерпретировать? Для полимеразной цепной реакции требуются сутки. Однако с учетом загруженности лабораторий сроки ожидания могут увеличиться до двух-трех дней. Результат трактуется однозначно. Отрицательный тест на вирус позволяет допустить его отсутствие в организме. Почему только допустить? Результат исследования может быть неточным. При получении ложноотрицательного есть вероятность, что: забор материала осуществлялся с нарушениями; анализ был взят на поздней стадии заболевания; вирус не попадал в носоглотку или быстро спустился по дыхательным путям; человек продезинфицировал полость рта антисептиком перед забором материала. Вероятность ложноположительного результата невелика. Такое возможно, если тестирование проводилось в антисанитарных условиях вирус попал в биоматериал после забора. Достоверно ли экспресс-тестирование? Различают такие виды экспресс-теста: исследование методом иммунохроматографии, использование набора реагентов. В первом случае человеку предлагается сдать кровь в медицинском учреждении. У анализа есть преимущества: низкая цена по сравнению с ПЦР; высокая скорость до получаса ; простота реализации. Однако точность его вызывает сомнения. Экспресс-анализ показывает только присутствие компонентов вируса, а не его самого. Поэтому все положительные пробы важно перепроверять методом ПЦР. С экспресс-наборами например, Standard Q Covid-19 человек работает сам. Это не аналог иммунохроматографии: кровь здесь не понадобится, достаточно мазка из носоглотки. Что именно нужно делать — написано в инструкции.