Хромосомный микроматричный анализ в отношении опухоли может использоваться у больных миелодиспластическим синдромом при нормальном кариотипе. Анализ производится с использованием ДНК-микрочипов. Разрешение метода обычно составляет десятки тысяч пар оснований. В Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА) для диагностики беременных.
Хромосомный микроматричный анализ (XMA)
Также встречаются вредные мутации — из-за них нарушается работа важных белков, наоборот, происходят достаточно часто. Все внешние признаки и особенности работы организма, которые человек получает от родителей, передаются с помощью генов. Это важнейшее свойство всех живых организмов называется наследственностью. В зависимости от того, как проявляются гены в тех или иных признаках, их делят на две большие группы. Доминантные гены. Выражаясь простым языком, эти гены более «сильные». Если в клетках присутствует хотя бы одна копия такого гена, его признаки проявятся.
Рецессивные гены «слабее» доминантных. Если у человека одна копия гена доминантная и одна рецессивная, — проявится признак доминантной. А для проявления рецессивного признака нужно две соответствующих копий. Например, карий цвет глаз у человека является доминантным. Поэтому у кареглазых родителей с высокой вероятностью родится кареглазый ребенок. Если у одного из родителей глаза карие, а у другого голубые, то вероятность рождения кареглазых детей в такой семье тоже высока.
У двух голубоглазых родителей, скорее всего, все дети тоже будут голубоглазыми. А вот у кареглазых родителей может родиться ребенок с голубыми глазами, если у обоих есть рецессивные «гены голубоглазости», и они достанутся ребенку. Конечно, это упрощенная схема, потому что за цвет глаз отвечает не один, а несколько генов, но на практике эти законы наследования зачастую работают. Аналогичным образом потомству могут передаваться и наследственные заболевания. Как выявляют рецессивные мутации? Для выявления мутаций, которые передаются рецессивно, используют целый ряд исследований.
Секвенирование по Сэнгеру — метод секвенирования определения последовательности нуклеотидов, буквально — «прочтение» генетического кода ДНК, также известен как метод обрыва цепи. Анализ используется для подтверждения выявленных мутаций. Это лучший метод для идентификации коротких тандемных повторов и секвенирования отдельных генов. Метод может обрабатывать только относительно короткие последовательности ДНК до 300—1000 пар оснований одновременно. Однако самым большим недостатком этого метода является большое количество времени, которое требуется для его проведения. Если неизвестно, какую нужно выявить мутацию, то используют специальные панели.
В 2021 году запланировано 650 таких обследований. Сам метод инвазивный. Для исследования подойдет любой материал, содержащий ДНК, — ворсина плаценты или жидкость внутри плодных оболочек. Учеными анализируются отдельные фрагменты генома с использованием специально подготовленной микроматрицы. В результате полученного метода одновременно исследуются более тысячи генов, в результате чего появилась возможность исключить более 250 тяжелых генетических заболеваний.
Таким образом, у врачей появилась возможность исключить свыше 250 тяжелых генетических заболеваний. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп», — приводит пресс-служба слова директора Медико-генетического центра Илдара Минниахметова. Ранее ИА REGNUM сообщало о том, что в конце прошлого года Башкирия стала победителем конкурсного отбора и получила федеральную поддержку на развитие Евразийского научно-образовательного центра мирового уровня.
Микроделеционные синдромы — хромосомные заболевания, которые вызваны отсутствием маленьких не видимых в микроскоп при стандартном кариотипировании участков хромосом микроделеции. Микродупликационные синдромы — хромосомные заболевания, которые вызваны наличием дополнительной копии небольших не видимых при стандартном кариотипировании участков хромосом микродупликации. Данный вид исследования позволяет диагностировать хромосомные перестройки размером от нескольких тысяч пар оснований до 5 Мb, не видимые в стандартный цитогенетический микроскоп, которые обозначены как вариации числа копий участков ДНК CNV. Клиническое значение CNV определяется размером перестройки, количеством и составом генов, входящих в этот участок, а также ее происхождением. С учетом того, что в области CNV находится несколько генов, при их утрате или удвоении генетической информации развиваются более сложные клинические проявления. Без проведения хромосомного микроматричного анализа портретная фенотипическая, по внешним проявлениям , диагностика большинства микроделеционных и микродупликационных синдромов не представляется возможным.
Хромосомный микроматричный анализ абортивного материала (CMA of miscarriage tissue)
Цена указана без взятия биоматериала В корзину Описание Подготовка Хромосомный микроматричный анализ ХМА — это молекулярно-генетическое исследование кариотипа, молекулярный кариотип. При выполнении ХМА с помощью специальной методики исследуются последовательности генетического материала во всех хромосомах и могут быть выявлены избыток или недостаток генетического материала числовые аномалии, дупликации и делеции хромосом, несбалансированные транслокации. ХМА имеет высокую разрешающую способность, то есть позволяет выявить достаточно мелкие структурные изменения.
Также можете поискать нужную информацию в похожих вопросах на этой странице или через страницу поиска по сайту. Мы будем очень благодарны, если Вы порекомендуете нас своим друзьям в социальных сетях. Медпортал 03online. Здесь Вы получаете ответы от реальных практикующих специалистов в своей области.
Молекулярное кариотипирование абортивного материала. ХМА является лучшим тестом для поиска причин неразвивающейся беременности, самопроизвольного выкидыша, мертворождения. Возможность выявления мутаций, связанных с аутосомно-рецессивными и аутосомно-доминантными заболеваниями, позволяет определить более точный прогноз при планировании следующей беременности. Скрининг на наследственные заболевания. Высочайшая точность детекции полиморфных маркеров позволят определить носительство вариантов мутаций аутосомно-рецессивных заболеваний и использовать ХМА при оценке риска наследственного заболевания у будущего ребенка.
При этом нарушение хромосомного набора может быть представлено изменением количества хромосом например, отсутствие одной из хромосом или, наоборот, появление в кариотипе дополнительной хромосомы или нарушением их структуры например, за счет вставки дупликации или потери делеции определённого участка хромосомы. Для подтверждения или исключения подобной причины выкидыша или неразвивающейся беременности необходимо провести хромосомный анализ абортивного материала. Данное молекулярно-цитогенетическое исследование позволяет с высокой точностью детектировать как анеуплоидии то есть видеть количественное изменение хромосомного набора эмбриона, в частности, подтвердить синдром Дауна трисомия 21 , Эдвардса трисомия 18 , Патау трисомия 13 и др.
Хромосомный микроматричный анализ: характеристика, использование и эффективность метода
Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) позволяет диагностировать хромосомные перестройки размером от нескольких тысяч пар оснований до 5 Мb. Докладывает: руководитель проекта ГЕНОМЕД, врач-генетик, д.м.н., профессор Коростелев Сергей АнатольевичТеперь стандартный хромосомный микроматричный анализ. Хромосомный микроматричный анализ (ХМА) помогает диагностировать хромосомные перестройки, даже те, которые не видны при стандартном генетическом исследовании. Молекулярное кариотипирование (хромосомный микроматричный анализ ХМА). В уфимском Республиканском медико-генетическом центре внедрили новый высокотехнологичный метод – полногеномный хромосомный микроматричный анализ (ХМА).
Хромосомный микроматричный анализ пренатальный таргетный
Хромосомный микроматричный анализ. Моногенные наследственные заболевания. Опубликованы Рекомендации Российского общества медицинских генетиков по хромосомному микроматричному анализу. Микроматричный хромосомный анализ (ХМА) — высокотехнологичный метод оценки кариотипа на предмет наличия определенных мутаций, связанных с увеличением количества. Технология микроматричного анализа, лежащая в основе теста, позволяет добиться высокой точности при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп», — приводит.
Башкирские генетики разработали новый метод пренатальной диагностики
Матрицы, используемые для ХМА, содержат до 6,85 млн. Благодаря этому получают информацию о наличии генетического материала в аналогичном количестве точек генома. Задавая нужную последовательность ДНК-зондов, можно конструировать чипы для выявления практически любых последовательностей ДНК, определения точечных полиморфизмов SNP , анализа копийности любых участков генома CNV , определения видовой принадлежности ДНК, а также анализа экспрессии генов. Применения в клинической практике: в пренатальной диагностике для поиска хромосомной патологии плода при наличии биохимических, ультразвуковых маркеров хромосомной патологии ХП плода, при повышенном риске ХП по результатам неизвазивного пренатального теста НИПТ ; в постанальной диагностике для детей со множественными пороками развития, малыми аномалиями развития, задержкой развития, аутизмом; для анализа постабортного материала для установления причины потери беременности; в онкологии для исследования опухолевых клеток.
Метод исследования: Хромосомный микроматричный анализ; Анализ экзонного уровня отличается повышенной плотностью покрытия, что позволяет с высокой точностью выявлять изменения числа копий. В каких случаях рекомендовано исследование: В качестве исследования первой линии пациентам с предполагаемым наследственным заболеванием, обусловленным хромосомным дисбалансом; В качестве метода диагностики недифференцированных синдромов у пациента с аутизмом, умственной отсталостью, задержкой психомоторного развития, судорожным синдромом, малыми аномалиями развития, множественными врожденными пороками развития; В целях валидации вариаций числа копий, выявленных при проведении секвинирования нового поколения; При выявлении единственной гетерозиготной мутации в гене, ассоциированном с аутосмно-рецессивным заболеванием, для поиска делеции или дупликации на втором аллеле.
Можно ознакомиться с описанием пациентов, у которых были выявлены подобные нарушения в том числе с использованием переводчика. Вам рекомендуется анализ кариотипа экспертного уровня обоим родителям, так как у плода выявлена несбалансированная транслокация. Если происходит потеря или переизбыток генетического материала - это несбалансированная транслокация.
Она может стать причиной остановки развития эмбриона на разных сроках беременности женщины, появления генетических нарушений у плода или рождения ребенка с тяжёлым заболеванием. Носитель сбалансированной транслокации не страдает от этого, но у него с высокой долей вероятности может родится ребёнок с транслокацией несбалансированной.
Без проведения хромосомного микроматричного анализа портретная фенотипическая, по внешним проявлениям , диагностика большинства микроделеционных и микродупликационных синдромов не представляется возможным.
Для чего ещё применяется ХМА? Хромосомный микроматричный анализ ХМА также применяется для диагностики недифференцированных синдромальных форм моногенных заболеваний в случае делеции утраты генов, если пациент имеет сходный с заболеванием клинический фенотип. Аналогично стандартному анализу кариотипа, с помощью ХМА можно выявить хромосомные анеуплоидии у пациента некратное изменение хромосомного набора, связанное с наличием дополнительной или отсутствием целой хромосомы.
Хромосомный микроматричный анализ позволяет выявить участки с потерей гетерозиготности, что актуально при однородительских дисомиях. Каковы ограничения ХМА? Хромосомный микроматричный анализ не выявляет сбалансированные хромосомные транслокации, инверсии, низкоуровневый мозаицизм, точковые мутации, экспансию тринуклеотидных повторов, а также изменения, находящиеся за границей разрешающей способности метода.
Хромосомный микроматричный анализ Стандартный
Анализ не позволяет выявить хромосомные аберрации, мозаицизм и мутации, не включенные в панель, митохондриальные заболевания, а также эпигенетические нарушения. Молекулярное кариотипирование (хромосомный микроматричный анализ ХМА). стандартный (молекулярно-генетический анализ aCGH) - для анализа абортивного материала при беременности прервавшейся до 12 недель. Предупредили, что в моем случае будет лучше сделать ХМА (хромосомный микроматричный анализ), но его в ЦПСиР не делают, посоветовали взять с собой на процедуру баночку. ХРОМОСОМНЫЙ МИКРОМАТРИЧНЫЙ АНАЛИЗ (ARRAY-CGH) с использованием матрицы со средней плотностью 750 тыс. маркеров.
Полногеномный хромосомный микроматричный анализ
Если неизвестно, какую нужно выявить мутацию, то используют специальные панели. Панель исследования — тестирование на наличие определенных мутаций, входящих в перечень конкретной панели исследования. Анализ позволяет выявить одномоментно разные мутации, которые могут приводить к генетическим заболеваниям. Анализ позволяет компоновать мутации в панели по частоте встречаемости скрининговые панели, направленные на выявление носительства патологической мутации, часто встречаемой в данном регионе или в определенной замкнутой популяции и по поражаемому органу или системе органов панель «Патология соединительной ткани». Но и у этого анализа есть ограничения. Анализ не позволяет выявить хромосомные аберрации, мозаицизм и мутации, не включенные в панель, митохондриальные заболевания, а также эпигенетические нарушения. Не в каждой семье можно отследить все возможные рецессивные заболевания. Тогда на помощь приходит секвенирование экзома — тест для определения генетических повреждений мутаций в ДНК путем исследования в одном тесте практически всех областей генома, кодирующих белки, изменения которых являются причиной наследственных болезней. Секвенирование следующего поколения-NGS — определение последовательности нуклеотидов в геномной ДНК или в совокупности информационных РНК транскриптоме путем амплификации копирования множества коротких участков генов. Это разнообразие генных фрагментов в итоге покрывает всю совокупность целевых генов или, при необходимости, весь геном. Анализ позволяет выявить точечные мутации, вставки, делеции, инверсии и перестановки в экзоме.
Анализ не позволяет выявить большие перестройки; мутации с изменением числа копий CNV ; мутации, вовлеченные в трехаллельное наследование; мутации митохондриального генома; эпигенетические эффекты; большие тринуклеотидные повторы; рецессивные мутации, связанные с Х-хромосомой, у женщин при заболеваниях, связанных с неравномерной Х-деактивацией, фенокопии и однородительские дисомии, и гены, имеющие близкие по структуре псевдогены, могут не распознаваться. Что делать, если в семье есть наследственное заболевание? Существуют два способа выявить наследственные генетические мутации у эмбриона: Предимплантационное генетическое тестирование ПГТ в цикле ЭКО. Это диагностика генетических заболеваний у эмбриона человека перед имплантацией в слизистую оболочку матки, то есть до начала беременности. Обычно для анализа проводится биопсия одного бластомера клетки зародыша у эмбриона на стадии дробления 4—10 бластомеров. Существует несколько видов ПГТ: на хромосомные отклонения, на моногенные заболевания и на структурные хромосомные перестройки. Но при исследовании эмбриона есть ряд ограничений. Так, из-за ограниченного числа клеток можно не определить мозаицизм. Если нет возможности провести ЭКО с ПГТ, то используют второй вариант — исследование плодного материала во время беременности. Для забора плодного материала используют инвазивные методы: биопсия хориона — когда берут клетки из плаценты; амниоцентез — когда берут клетки амниотической жидкости.
Далее эти клетки исследуют при помощи одного или нескольких генетических тестов которые имеют свои ограничения. Таким образом, проведя дополнительные исследования, можно значительно снизить риск рождения ребенка с генетическим заболеванием в конкретной семье. Но привести этот риск к нулю на сегодняшний день, к сожалению, невозможно, так как любой генетический тест имеет ряд ограничений, что делает невозможным исключить абсолютно все генетические болезни. Автор статьи Пелина Ангелина Георгиевна Врач-генетик Ведёт генетическое обследование доноров Репробанка, осуществляет подбор доноров для пар, имеющих ранее рождённых детей с установленной генетической патологией.
ХМА опухолей позволяет сделать полногеномное исследование числа копий с детекцией участков с потерей гетерозиготности LOH, с улучшенным разрешением по 900 опухолевым генам, определить статус часто исследуемых соматических мутаций.
Все эти данные можно получить на материале одной пробы. ХМА в отношении опухоли может использоваться у больных миелодиспластическим синдромом при нормальном кариотипе. ХМА обнаруживает достаточно мелкие изменения, которые, позволяют определять прогноз и тактику лечения пациентов.
Метод полностью заменяет кариотип и дает возможность определить контаминацию образца материнским материалом, что исключает риск ложноотрицательных результатов. Хромосомный микроматричный анализ таргетный Таргетный хромосомный микроматричный анализ выполняется на микроматрицах имеющих 350 тыс маркеров сосредоточенных в основных клинически значимых участках генома. Разрешающая способность таргетного ХМА от 1 000 000 п. Этот анализ рекомендуется для диагностики специфических синдромов, когда необходимо их лабораторное подтверждение. Таргетный хромосомный микроматричный анализ является информативным для выявления причин потери беременности замершая беременность, спонтанные аборты, прерывание беременности по медицинским показаниям.
При этом могут быть выявлены анеуплоидии, структурные перестройки от 1 000 000 п. Таргетный ХМА позволяет определить происхождение дополнительного набора хромосом при триплоидиях и дифференцировать доброкачественную дигиническую триплоидию от частичного пузырного заноса. Таргетный ХМА, также, позволяет диагностировать полный пузырный занос. Хромосомный микроматричный анализ в сфере исследования опухолей позволяет сделать полногеномное исследование числа копий с детекцией участков с потерей гетерозиготности LOH, с улучшенным разрешением по 900 опухолевым генам, определить статус часто исследуемых соматических мутаций.
Хромосомы и хромосомные болезни Исследование хромосомных отклонений методом ХМА Хромосомы и хромосомные болезни Хромосомы — ядерные структуры, содержащие генетическую информацию. Они отвечают за наследуемые физические характеристики рост, размер ноги, цвет волос и глаз , а также за умственное и психическое развитие, функционирование основных систем организма. Генетический материал распределён по хромосомам в строго определённом порядке, последовательность сохраняется одинаковой для всех людей. Полный хромосомный набор называют кариотипом. В норме кариотип человека содержит 46 хромосом, которые объединены в 23 пары. Нормальный мужской кариотип — 46,XY; нормальный женский — 46,XX.
Генетический анализ крови
Грубое кариотипирование с этим не справится. Это так называемые микроделеционные и микродупликационные синдромы. Хромосомный микроматричный анализ позволяет с высокой точностью выявить заболевания аутистического спектра, причины множественных врожденных пороков развития и дать прогноз. Довольно часто по результатам ХМА у ребенка требуется провести обследование родителей на предмет уточнения диагноза, и прогноза для последующих рождений детей. Чисто физически для этого анализа необходима обычная кровь в объеме 2 мл, как и для других видов исследований. Стандартная процедура проводится на микроматрице, которая содержит около одного миллиона маркеров, перекрывающие клинически значимые участки генома.
Разрешающая способность этого анализа позволяет распознать расстройство на протяжённости минимум 50000 пар нуклеотидов, это весьма высокая точность. Секвенирование генома и экзома Что такое генетический анализ крови под названием «секвенирование»? Это ведущий метод современных и высокотехнологичных генетических лабораторий, он позволяет прочитать содержимое генов, то есть определить нуклеотидную последовательность ДНК и описать её первичную структуру, что является следующей ступенью точности по сравнению с ХМА. Эти методы называются новыми, поскольку они позволяют с большой скоростью прочитать сразу несколько участков генома, в отличие от более ранних и медленных методик генетического секвенирования. С помощью этого метода перечисляются все азотистые основания, которые входят в состав того или иного гена, кодирующего те или иные белки.
Если довести этот метод до совершенства, то можно провести секвенирование всего наследственного материала индивидуума, и такие методики действительно есть. Они называются секвенирование генома и экзома. Что это такое и зачем они применяются? Известно, что генами называются определённые последовательности нуклеотидов, которые кодируют синтез определённых белков. В генах существуют участки, которые несут информацию и которые можно прочитать и воплотить в аминокислотную цепь в процессе синтеза белка.
Но есть и участки, которые информации не несут, но они всё равно нужны. Читайте также: Анализ крови на иммуноглобулины Поэтому генетический код можно сравнить с книгой, в которой не все страницы заполнены словами и буквами, а встречаются иногда значительные пробелы: или целых абзацев, и даже целых страниц. Поэтому секвенированием экзома называют процесс анализа всех участков ДНК, которая кодирует специфические белки, а «пустые разделы» последовательностей не исследуются.
Например, карий цвет глаз у человека является доминантным.
Поэтому у кареглазых родителей с высокой вероятностью родится кареглазый ребенок. Если у одного из родителей глаза карие, а у другого голубые, то вероятность рождения кареглазых детей в такой семье тоже высока. У двух голубоглазых родителей, скорее всего, все дети тоже будут голубоглазыми. А вот у кареглазых родителей может родиться ребенок с голубыми глазами, если у обоих есть рецессивные «гены голубоглазости», и они достанутся ребенку.
Конечно, это упрощенная схема, потому что за цвет глаз отвечает не один, а несколько генов, но на практике эти законы наследования зачастую работают. Аналогичным образом потомству могут передаваться и наследственные заболевания. Как выявляют рецессивные мутации? Для выявления мутаций, которые передаются рецессивно, используют целый ряд исследований.
Секвенирование по Сэнгеру — метод секвенирования определения последовательности нуклеотидов, буквально — «прочтение» генетического кода ДНК, также известен как метод обрыва цепи. Анализ используется для подтверждения выявленных мутаций. Это лучший метод для идентификации коротких тандемных повторов и секвенирования отдельных генов. Метод может обрабатывать только относительно короткие последовательности ДНК до 300—1000 пар оснований одновременно.
Однако самым большим недостатком этого метода является большое количество времени, которое требуется для его проведения. Если неизвестно, какую нужно выявить мутацию, то используют специальные панели. Панель исследования — тестирование на наличие определенных мутаций, входящих в перечень конкретной панели исследования. Анализ позволяет выявить одномоментно разные мутации, которые могут приводить к генетическим заболеваниям.
Анализ позволяет компоновать мутации в панели по частоте встречаемости скрининговые панели, направленные на выявление носительства патологической мутации, часто встречаемой в данном регионе или в определенной замкнутой популяции и по поражаемому органу или системе органов панель «Патология соединительной ткани». Но и у этого анализа есть ограничения. Анализ не позволяет выявить хромосомные аберрации, мозаицизм и мутации, не включенные в панель, митохондриальные заболевания, а также эпигенетические нарушения. Не в каждой семье можно отследить все возможные рецессивные заболевания.
Тогда на помощь приходит секвенирование экзома — тест для определения генетических повреждений мутаций в ДНК путем исследования в одном тесте практически всех областей генома, кодирующих белки, изменения которых являются причиной наследственных болезней. Секвенирование следующего поколения-NGS — определение последовательности нуклеотидов в геномной ДНК или в совокупности информационных РНК транскриптоме путем амплификации копирования множества коротких участков генов. Это разнообразие генных фрагментов в итоге покрывает всю совокупность целевых генов или, при необходимости, весь геном. Анализ позволяет выявить точечные мутации, вставки, делеции, инверсии и перестановки в экзоме.
Анализируются отдельные фрагменты генома с использованием специально подготовленной микроматрицы. Одновременно исследуются более тысячи генов, и появляется возможность исключить более 250 тяжелых генетических заболеваний. С помощью этого метода выявляются нарушения, которые стандартным цитогенетическим исследованием кариотипа выявить невозможно. Может быть поврежден крохотный участок в плече хромосомы и с помощью ХМА его можно зафиксиолвать несмотря на то, что повреждение может быть насколько мало, что человеческий глаз его просто не заметит.
Тест ХМА проходит на микроматрице высокой плотности, состоящей из свыше 1 миллиона маркеров генома. Разрешающая способность стандартного ХМА-теста от 100 000 п. Какой биоматериал нужен для исследования? Материал для исследования: амниотическая жидкость, ворсины хориона, пуповинная кровь.
Дополнительных правил подготовки к тесту нет.